二重組換えクラスの検出は、二重交差が発生しなければならないことを示しています。これを知っていると、隣接する染色体領域の交差は独立しているのか、1つの領域のdosa交差は隣接領域に交差がある可能性に影響を与えますか。 それはしばしば彼らが独立していないことが判明しました：相互作用は干渉と呼ばれます。
分析には以下の方法でアプローチすることができます。 二つの領域のクロスオーバーが独立している場合、積規則（37ページ参照）によれば、二重結合基の頻度は隣接する領域の組換え頻度の積に等しくなる。 V-ct-cv再結合データでは、v–ct RF値は0.132であり、値は0.064であるため、独立性がある場合、周波数0.132×ct–cv0.064=0.0084（0.84パーセント）で二重結合が予想される。 1448個のハエのサンプルでは、0.0084×1448=12個の二重組換え体が期待される。しかし、データは8だけが実際に観察されたことを示しています。 二重組換え体のこの欠損が一貫して観察された場合、二つの領域が独立していないことが示され、クロスオーバーの分布がダブルスを犠牲にしてシングルを好むことが示唆される。 言い換えると、ある種の干渉があります：交差は、隣接領域における交差の確率を減少させます。
干渉は、最初に観測された予想される二重組換え体に対する比である一致係数（c.o.c.）と呼ばれる項を計算することによって定量化されます。 したがって、
干渉(I)=1−c.o.c. =
この例では
一部の地域では、二重組換え体が観測されたことはありません。 これらの場合、c.o.c.=0なので、I=1で干渉が完了します。 ほとんどの場合、染色体遺伝子座のマッピングに含まれる干渉値は0から1の間であるが、特定の特殊な状況では、観測された倍精度が予想を超え、負の干渉値を与える。
再結合解析は、三点テストクロスと拡張バージョンのofthemに非常に大きく依存しているため、解析の段階的な要約を作成し、干渉計算で終わる価値があ V、ct、およびcv遺伝子座のデータからの数値を使用します。
遺伝子の各ペアの組換え頻度を計算する:
は、リンケージマップ内のリンケージ関係を表します:
二重組換えクラスを決定します。
干渉がない場合に期待される二重組換え体の頻度と数を計算します:
干渉を計算します:
ショウジョウバエの連鎖の例では、なぜ私たちは常にテストクロスにヘテロ接合体の女性を使用するのか疑問に思っているかもしれません。 Ｐｒｖｇ／ｐｒ＋ｖｇ＋雄をｐｒｖｇ／ｐｒｖｇ雌と交配すると，ｐｒｖｇ／ｐｒ＋ｖｇ＋およびｐｒｖｇ／ｐｒｖｇ前駆体のみが回復する。 この結果は，ショウジョウバエには交叉がないことを示している。 しかし、この1つの性別での交配の欠如は特定の種に限定されています。 他の生物では、XY男性とWZ女性に交差オーバーがあります。 の欠如の理由ショウジョウバエの男性における交差オーバーは、シナプトンエマル複合体を伴わない異常な前期Iを有することである。
ちなみに、人間の性別にも組み換えの違いがあります。 女性は男性よりも同じ遺伝子座に対して高い組換え頻度を示す。