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米国で最も頻繁に報告されている性感染症は、寄生細菌Chlamydia trachomatisによって引き起こされます。 感染の約50万例が毎年報告されていますが、より現実的な発生率は年間約400万例です。 これは、人口内に無症候性の個人の大きなプールがあるためです。 治療せずに放置すると、クラミジア感染症は骨盤内炎症性疾患（PID）に発展し、重度ではあるが治癒可能な眼疾患（トラコーマ）を引き起こす可能性がある。

クラミジアゲノムプロジェクトコンソーシアムは最近、C.trachomatisゲノムの配列を決定しました。 それは約1,045,000塩基対の円形染色体を有し、大腸菌の約四分の一の大きさである。 配列の分析は888の蛋白質コード遺伝子を識別しました。 これらの中で、いくつかのタンパク質は、型破りな自然史を持っているように見えます。

このゲノムは異常に多くの水平遺伝子導入事象を経験しているようであり、C.trachomatisの寄生性が遺伝子導入のより大きな機会を提供することを示唆している。 もっと奇妙なのは、しかし、Cのいくつかということです。 trachomatis蛋白質は他の細菌か人間のホストにより緑の植物ともっと関連しています。

膜生合成の脂肪酸合成成分に関与する二つのクラミジアタンパク質であるFabIとFabFは、それらの植物の対応物と最も密接に関連しているようであるが、リポ多糖生合成に関与するplsBは植物オルソログのみを有する。

これがどのようになったのかは、二つの情報をリンクすることに依存しています。 第一に、クラミジア様寄生虫は、通常、真水または土壌中に見出されるが、ヒト病原体として発生する可能性のある自由に生きている原生動物であるアカン おそらくAcanthamoebaはクラミジアの元の宿主を表し、そのクラミジア寄生虫をヒトに移すためのベクターとして役立った。 第二に、16s様RNAから作られた推論は、アカントアメーバが系統発生的に緑色植物に関連しているという証拠を提供する。 したがって、いくつかのアカントアメーバと緑の植物の遺伝子が非常に関連していると予想されます。 したがって，アカントアメーバ（宿主）とクラミジア（寄生虫）との間の水平移動は，クラミジアに植物様遺伝子を与える可能性がある。 クラミジアがヒトに渡される前にこの水平移動が起こった場合、ヒト寄生虫は植物様遺伝子を有する可能性がある。

クラミジアのゲノム解析は、ヒトの病気の原因となる寄生虫を含む他の真核生物の寄生虫をより深く理解するための出発点となるでしょう。