CI-MSは、分析物を試薬ガスのイオンと反応させる質量分光法です。
通常の電子イオン化質量分析であるEI-MSでは、分析物に高エネルギー電子が衝撃されてイオンが生成されます。 精力的なイオンは多くの分裂プロダクトに破壊します。
化学イオン化質量分析では、分析物はメタン、アンモニア、イソブタンなどの試薬ガスを大量に含んでいます。
電子ビームは試薬ガスを優先的にイオン化する。 他の試薬ガス分子との衝突は、イオン化プラズマを生成する。
その後、プラズマは分析物と反応して正および負のイオンを形成する。
CIはEIよりもエネルギーの低いプロセスです。 それは頻繁により少ない分裂およびより簡単なスペクトルをもたらす。 CIスペクトルは、通常、容易に識別可能な分子イオンを有する。
質量スペクトルを分析するときは、まず分子イオンを特定します。 その後、断片を識別するのはかなり簡単です。
EIでは、分子イオンが存在しないか、確認するには弱すぎる可能性があります。
対照的に、CIはEIよりも柔らかいイオン化方法です。 断片化は起こりにくいので、分子イオンはより顕著である。
例えば、糖はOH基をトリメチルシリル(TMS)エーテルに変換することにより、より揮発性にすることができる。
ROH+(CH≤)≤sicl→RO-Si(CH≤)≤
スクロースは8つのOH基を有する。
分子式C2H2O2Si2のocta-TMSエーテルを形成します。
EIスペクトルは検出可能な分子イオンを示さない。
対照的に，試薬ガスとしてアンモニアを用いたＣＩスペクトルは顕著な分子イオン（Ｍ＋ＮＨ Β）を示した。