ヒト癌におけるクロモトリプシス

Harvard Medical SchoolとEMBL-EBIの研究者は、新たに発見された突然変異現象chromothripsisの癌タイプ全体で最大の分析を実施しました。 この研究は、38種類の癌にまたがる2600以上の腫瘍からの全ゲノム配列決定（WGS）データを含む、これまでのその種の中で最大のものです。

Chromothripsis

Chromothripsis、または”染色体粉砕”は、染色体の大規模なストレッチが単一の壊滅的なイベントで大規模な再配列を受ける変異プロセスです。 染色体領域は、より小さな断片に断片化し、再配置し、再結合し、新しいゲノム構成につながる。

これらの変化ががんゲノム進化をどのように駆動するか、そしてその生成にどのような分子機構が関与しているかを完全に理解することは、がんゲノム進化を理解するための重要なステップです。

この研究は、1300人以上の科学者の国際協力を含む世界的な取り組みであるPan-Cancer Analysis of Whole Genomes(PCAWG)プロジェクトの一環としてNature Geneticsに掲載されました。 この研究では、研究者らは、クロモトリプシス事象が以前に考えられていたよりも多くの種類の癌にわたってはるかに一般的であることを示した。 彼らはまた、癌遺伝子増幅（癌を引き起こす可能性のある遺伝子のコピー数の増加）、および腫瘍抑制因子（細胞の成長および分裂を調節する遺伝子）の喪失EMBL-EBIのグループリーダーでハーバード大学医学部の元ポスドク研究員であるIsidro Cortés-Ciriano氏は次のように述べています。

がんにおける染色体裂傷の有病率

「30種類以上のがん 「このことから、我々は、クロモトリプシス事象および他のタイプの複雑なゲノム再配列がヒト癌全体に普及しており、一部の癌タイプでは腫瘍の50％を超”

WGSデータセットを使用すると、研究者は癌ゲノムにおけるクロモトリプシス事象の強化されたビューを与えました。 癌および先天性疾患におけるクロモトリプシスの役割を検討している以前の研究では、しばしば低解像度アレイベースの技術が使用されていました。 ここでは、研究者らは、chromothripsisイベントが以前に推定されたよりも癌ではるかに一般的であることを示すことができました。 彼らはまた、癌の種類にまたがる大規模なゲノム変化のパターンを特徴づけ、それらの生成に関与するDNA修復メカニズムを研究した。

“この研究は、大規模な全ゲノム配列決定の力のさらに別のデモンストレーションです”と、ハーバード-メディカル-スクールの生物医学情報学教授であり、論文の上級著者であるPeter Park氏は述べています。 “それは私たちが癌ゲノムにおけるゲノム粉砕の途方もない複雑さを調査し、何百もの症例にわたって共通の特徴を特徴付けることを可能にした。「

染色体崩壊とがんの予後

「このプロジェクトで行われた発見により、がんがどのように発生し、進化するか、またヒト腫瘍のDNAの変化のパターンをよりよく理解することができました」とCortés-Ciriano氏は述べています。 「これらの変化のいくつかは強力な臨床的意味を持ち、今後数年間で治療開発のための新しい道を開く可能性があります。”

研究者らは、chromothripsisが腫瘍ゲノムを形成し、腫瘍抑制遺伝子の喪失および癌遺伝子の増幅をもたらし、癌の進行を促進することを実証している。 Chromothripsisは癌患者の予後不良と関連していますが、このような継続的な研究は、chromothripsisおよび他の大規模なゲノム変化の影響を理解するのに役立ち、将来的には癌診断にどのように使用されるかを理解するのに役立ちます。

汎がんプロジェクト

汎がん全ゲノム解析プロジェクトは、1300カ国から37人以上の科学者と臨床医が参加した共同プロジェクトです。 これは、2600以上の38の異なる腫瘍タイプのゲノムの分析を含み、原発性癌ゲノムの巨大なリソースを作成します。 これは、がんの発生、因果関係、進行、および分類の複数の側面を研究するための16のワーキンググループの出発点でした。