ピザですか？クレジット：ゲイリー-ハーシュホーン/ゲッティ
ニューヨーク市のネズミは適応可能ではないにしても何もありません。 彼らはピザ、ホットドッグ、さらにはサラダを食べ、地下鉄のトンネルから遊び場の砂場まで、五つの自治区のほぼすべての隅に生息しています。
彼らのゲノムは現在、約2万匹の生き物がいると考えられているニューヨークなどの都市を征服するラットの能力への手がかりを提供しています。 今月bioRxivに投稿された研究1では、遺伝学者は、ニューヨークのラットが繁栄するのを助けたかもしれない食事、行動、運動に関与する数十の遺伝子を同定した。
「進化生物学者でありニューヨーカーである私は、ラットが都市環境に適応した方法に驚かずにはいられない」と、都市のコロンビア大学の人口遺伝学者Arbel Harpak 彼は進化生物学者Jason Munshi-South、ニューヨークのArmonkのFordham大学、およびカリフォルニアのサンフランシスコ州立大学のPleuni Penningsと共同で研究を主導しました。
ニューヨークのネズミの進化の商標を探す前に、研究者は最初にそれらを捕まえなければならなかった。 2014年から2015年の間に、都市の進化と生態学を専門とするMushin-Southのチームは、市内から約400匹の茶色のラット（Rattus norvegicus）を集め、ベーコン、ピーナッツバター、オート麦を混ぜた罠に誘 研究者らはその後、これらのラットの29の完全なゲノムを配列決定し、茶色のラット2の推定祖先の家である中国北東部の農村部のラットの以前に配列決定されたゲノムと比較した。
遺伝的変異
Harpakのチームは、ニューヨーク市のラットにとって非常に有益である可能性が高い変異を含むゲノムの領域を探し、すぐに地元の集団間で 選択的掃引として知られている進化過程は、ヒトでも起こり、例えば、一部のヒトが成人として牛乳を消化することを可能にする遺伝子変異体を広
このスキャンでは、ラットの選択的掃引の特徴を持つ数十の遺伝子のリストが作成されました。 この遺伝子には、食事、行動、移動性に関連するいくつかのものが含まれています—ビッグアップルの人生の課題や喜びを潜在的に反映しています。 チームが植物化合物を解毒するために重要である可能性があると同定した遺伝子であるCYP2D1は、市のラットがケールサラダを楽しむのを助けるこ
Harpakは、彼のチームのリストを将来の研究の出発点と見なしています。 例えば、トランスジェニックラボラットの試験では、新しいニューロンの成長に関与する遺伝子の変化がラットの行動を変えたのか、炭水化物と砂糖の代謝に関連していると同定された他の遺伝子がラットの食事に影響を与えたのかどうかを説明することができました。Columbiaの進化遺伝学者で神経科学者であるAndrés Bendesky氏は、研究者が特定した遺伝子のいくつかが脳の配線に関与していることは興味深いと述べています。 研究者らは、動物が神経回路を変えることによって新しい環境に適応する可能性があると仮定しているが、Bendeskyは誰もこれをまだ示していないと言
時代の変化と場所の変化
Harpak氏は、彼と彼の同僚は、19世紀のニューヨークラットからのDNAを見ることによって選択的掃引がいつ発生したかを判断したいと考えていると述べている。 彼らは、彼らのゲノムがニューヨーク市のラットのそれと同じように進化しているかどうかを確認するために他の都市からラットをキャッ
最近の1つの経験に基づいて、進化生物学者Hopi Hoekstraは、他の都市からのラットの遺伝的適応に少なくともいくつかの違いがあると予想しています。 約一ヶ月前、マサチューセッツ州ケンブリッジのハーバード大学にいるHoekstraは、彼女の家の地下にラットをトラップしようとしました。 “私はのようだった、”このラットは間違った家を選んだ。”、”野生のげっ歯類の遺伝学を研究Hoekstraは述べています。 “私は25年間ラットを捕獲してきました。”
犯人を捕まえることができなかった数週間後、彼女は駆除業者に電話し、彼女が設定していたピーナッツバターレースのトラップよりも、ダンキンドーナツペストリーとスリムジム、乾燥ソーセージのスナックを好むケンブリッジのラットのために間違った餌を使用していると言った。 駆除業者はHoekstraのラットが彼女の地下室に入るのに使用していた穴を満たしたが、彼は今DNA分析のためにケンブリッジのラットを収集している。 “紙が出てきたとき、それはちょうどクリックしました。 もちろん違いがありました。 地元の駆除業者は、彼らが異なっていることを知っている、”Hoekstra氏は述べています。