エリスは1969年から1972年までベル研究所で計算の理論に適用される確率論で働いた。 1972年、コロラド大学ボルダー校のコンピュータサイエンス学科の助教授となり、オペレーティングシステムの研究に取り組んだ。
エリスは、ARPANETに関連する研究に取り組むためにMITのEECSの助教授として三年後に位置を受け入れました。 彼は1年後にMITを離れ、Xerox PARCとスタンフォード大学で働き始めました。 エリスは、ほぼ十年のためにゼロックスPARCとスタンフォード大学に残りました。 その間、アイコンベースのGUI、オブジェクト指向プログラミング言語、グループウェアシステムに取り組んでいました。 “彼はAlto、世界初のパーソナルコンピュータ（PC）とその関連するインターフェイスとソフトウェアに取り組んだ社会学者、心理学者、コンピュータ科学者のチーム 1970年代からのこれらの技術革新の多くは、後にAppleのLisaコンピュータやMicrosoftのMS-DOSソフトウェアなどで広く製品化されました。 PARCでは、EllisがOffice Research Groupを率いて、iconsとEthernetを使用して遠隔地でのコラボレーションに最初のオフィスシステムを開発しました。”
1980年代半ば、EllisはMicroelectronics and Computer Technology Corporation(MCC)のグループウェア研究グループを率いました。 MCCでは、リアルタイムの共同編集の取り組みを主導し、運用変革の分野を開拓しました。 1990年代初頭、EllisはMccを離れ、フランスのBull S.A.のFlowPathワークフロー製品のチーフアーキテクトになりました。
1992年、EllisはColorado Boulder大学に戻り、コンピュータサイエンス学科の専任教授として勤務しました。 そこで、グループウェア、特に次世代の大規模ワークフローシステム、エージェントを介した会議支援システムの研究を続けました。 2009年、彼は大学の名誉教授になり、”すべての民族の学生が視野を広げることを奨励するために、コンピュータ入門コースを定期的に教えることを主張した。”学生が科学と工学を追求するためのさらなる機会を提供するために、Ellisは”大学で10週間の夏の多文化研究研修へのアクセス（SMART）プログラムを確立す”
2013年、Ellisはフルブライト奨学金を獲得し、Ashesi大学のコンピュータサイエンス部門で研究を教え、実行しました。 Ashesiでは、彼の研究の関心は、発展途上国のための政府の代替形態をシミュレートするためのコンピュータシステムを開発していました。