Invia…
A. per “taglia e incolla”: (i) una singola sequenza in formato FASTA o onlyplain sequence, o (ii) sequenze multiple in formato FASTA.
B. un file in formato FASTA. Digita direttamente il percorso del file o usail pulsante “Sfoglia” per trovare il tuo file.
NOTA: ChloroP accetta solo sequenze di aminoacidi.
Includi l’N-terminus
Si raccomanda vivamente di includere l’N-terminus della sequenza inviata.Più lontano dal residuo N-terminale inizia la sequenza inviata, più difficile e inaffidabile sarà la previsione.
Invia preferibilmente circa 100 residui
Invia se possibile circa 100 residui N-terminale. La lunghezza suggerita è dovuta al fatto che il predittore”cTP”/” no cTP ” è stato addestrato con sequenze di input di lunghezza 100 residui. Tuttavia, sequenze più brevi possono anche essere soddisfattamenteprevisto (è più importante che la parte N-terminale sia intatta). Thecleavage site prediction is restricted to search for a potential clivage sitewithin the 100 most N-terminal residues and is in itself not influenced bysequence length.
Nomi di sequenza
Il nome delle sequenze può essere di qualsiasi lunghezza, ma solo i primi 20 caratteri verranno conservati per tutta la previsione e presentati nella pagina dei risultati di previsione Chlorop.
Output dettagliato
Seleziona questa casella se desideri che il punteggio della rete neurale sia presentato anche per eachresidue (e non solo per ogni sequenza).Viene inoltre presentato un derivato del punteggio di rete utilizzato per trovare l’area in cui viene cercato il sito di taglio (i 40 residui che circondano il residuo con il punteggio derivato più alto), insieme al punteggio del sito di taglio (CS-score) per ciascun residuo.