I clostridi sono batteri gram-positivi, anaerobici, che formano endospore, incapaci di riduzione del solfato dissimilatorio. Comprendente circa 180 specie, il genere Clostridium è uno dei più grandi generi batterici. La fisiologia è principalmente dedicata alla produzione di acido. Numerosi percorsi sono noti, come la fermentazione omoacetato da acetogeni, la fermentazione propionato da Clostridium propionicum, e la fermentazione butirrato/butanolo da C. acetobutylicum, un noto produttore di solventi. I clostridi degradano zuccheri, alcoli, amminoacidi, purine, pirimidine e polimeri come amido e cellulosa. Il risparmio energetico può essere eseguito mediante fosforilazione a livello di substrato e dalla generazione di gradienti ionici. La formazione dell’endospore assomiglia al meccanismo chiarito in Bacillus. La morfologia, il contenuto e le proprietà delle spore sono molto simili alle endospore dei bacilli. I clostridi sporulanti di solito formano cellule madri gonfie e accumulano la sostanza di stoccaggio granulosa. Tuttavia, la sporulazione clostridiale differisce non impiegando il cosiddetto phosphorelay. L’iniziazione inizia dalla fosforilazione diretta del regolatore principale Spo0A. La cascata di fattori sigma specifici della sporulazione è di nuovo identica a ciò che è noto da Bacillus. L’inizio della sporulazione è accoppiato in alcune specie a solvente (acetone, butanolo) o tossina (ad esempio, C. perfringens enterotossina) formazione. La germinazione delle spore è spesso indotta da vari amminoacidi, spesso in combinazione con ioni fosfato e sodio. Nelle applicazioni mediche, le spore di C. butyricum sono usate come C. profilassi difficile e come trattamento contro la diarrea. Le spore ricombinanti sono attualmente in fase di studio e test come agenti antitumorali, perché germinano solo nei tessuti ipossici (cioè nel tessuto tumorale), consentendo un targeting preciso e l’uccisione diretta delle cellule tumorali.