C-DNA

Da non confondere con il DNA complementare, noto anche come cDNA.

Il C-DNA, noto anche come C-form DNA, è una delle molte possibili conformazioni a doppia elica del DNA. Il DNA può essere indotto a prendere questa forma in condizioni particolari come l’umidità relativamente bassa e la presenza di alcuni ioni, come Li+ o Mg2+, ma il DNA della forma C non è molto stabile e non si trova naturalmente negli organismi viventi.

Recenti ricerche suggeriscono che sia il C-DNA che il B-DNA sono costituiti da due distinte conformazioni nucleotidiche, B-I e B-II. Il rapporto di conformazione B-II nel C-DNA è superiore al 40%, ma nel B-DNA il rapporto è solo del 10% circa. C-DNA esiste come una doppia elica con una svolta destrorsa e 9,33 coppie di basi per giro completo.

Le controioni come le ammidi primarie in condizioni di base sono state utilizzate in esperimenti per mostrare la relazione tra le forme B e C del DNA. La forma complessiva e l’orientamento del DNA dipendono fortemente dalla sua sequenza primaria e dal legame dell’idrogeno tra le sue coppie di basi, che stabilizza e mantiene la conformazione a doppia elica. È stato dimostrato che il C-DNA mantiene la sua conformazione in assenza di acqua ed è stato in grado di formarsi dopo la disidratazione. Alcune ammidi in condizioni di base e bassa umidità hanno dimostrato di mantenere la conformazione della forma C, ma sono passate senza problemi al DNA della forma B man mano che l’umidità è aumentata. Ciò potrebbe suggerire una forte correlazione tra C-form e B-form DNA, che è stato anche visto utilizzando sale di litio a bassa umidità.

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