Rudolf Clausius, i fuld Rudolf Julius Emanuel Clausius, (født 2.januar 1822, K Kristslin, Preussen —død 24. August 1888, Bonn, Tyskland), Tysk matematisk fysiker, der formulerede termodynamikens anden lov og krediteres for at gøre termodynamik til en videnskab.
Clausius blev udnævnt til professor i fysik ved artilleri-og ingeniørskolen i Berlin i 1850, samme år, hvor han præsenterede et papir med angivelse af termodynamikens anden lov i den velkendte form: “Varme kan ikke i sig selv passere fra en koldere til en varmere krop.”Han anvendte sine resultater på en udtømmende udvikling af dampmotorens teori og understregede begrebet entropi (spredning af tilgængelig energi). Han blev professor i fysik ved Kristich Polytechnikum i 1855 og bidrog to år senere til teorien om elektrolyse (nedbrydning af en forbindelse med elektricitet) ved at antyde, at molekyler består af konstant ombyttende atomer, og at elektrisk kraft ikke forårsager, men blot styrer udvekslingen. Denne opfattelse blev senere brugt som grundlag for teorien om elektrolytisk dissociation (nedbrydning af molekyler i ladede atomer eller ioner).
han blev professor i fysik ved Universitetet i København i 1867 og ved Universitetet i Bonn i 1869. I molekylær fysik gentog Clausius den franske fysiker Sadi Carnot ‘ s princip om effektivitet af varmemotorer og gav således et meget sundere grundlag for teorien om varme.