CI-MS är en masspektroskopisk teknik där analyten reagerar med joner av en reagensgas.
i vanlig elektronjoniseringsmasspektrometri, EI-MS, bombarderas analyten med energiska elektroner för att producera joner. De energiska jonerna bryts ner i många fragmenteringsprodukter.
i kemisk joniseringsmasspektrometri är analyten i ett stort överskott av en reagensgas, såsom metan, ammoniak eller isobutan.
elektronstrålen joniserar företrädesvis reagensgasen. Kollisioner med andra reagensgasmolekyler skapar en joniseringsplasma.
plasman reagerar sedan med analyten för att bilda positiva och negativa joner.
CI är en lägre energiprocess än EI. Det ger ofta mindre fragmentering och ett enklare spektrum. Ett CI-spektrum har vanligtvis en lätt identifierbar molekyljon.
när du analyserar masspektra identifierar du först molekylära joner. Då är det ganska lätt att identifiera fragmenten.
med EI kan det inte finnas några molekylära joner eller de kan vara för svaga för att bekräfta.
däremot är CI en mjukare joniseringsmetod än EI. Fragmentering är mindre sannolikt att inträffa, så de molekylära jonerna är mer framträdande.
till exempel kan sockerarter göras mer flyktiga genom att omvandla sina OH-grupper till trimetylsilyl (TMS) etrar.
ROH + (CHFERON), acucyl r-si(CHCERON),
sackaros har 8 OH-grupper.
den bildar en okta-TMS-eter med molekylformeln Czungherh Suggendico^^.
ei-spektrumet visar ingen detekterbar molekyljon.
däremot visar CI-spektrumet med ammoniak som reagensgasen en framträdande molekylär Jon (M+nh-Hacienda), 2.