Vad är extrakromosomalt cirkulärt DNA och vad gör det?

det är känt att DNA i cellkärnan är förpackat i form av linjära kromosomer. Under många år har forskare observerat mindre längder av DNA tillsammans med kromosomerna som är organiserade i cirkulära former. Några av dessa partiklar, som har kallats extrakromosomalt cirkulärt DNA (eccDNAs) eller mikrodnas, är vanligtvis små (<1 kb), gen-glesa och icke-förstärkta. Totalt eccDNA-överflöd i celler kan vara upp till några hundra per cell. eccDNA-molekyler finns också i cirkulationen i cellfri form och erbjuder möjligheten att fungera som blodbaserade biomarkörer. I tumörer kan en annan typ av extrakromosomalt cirkulärt DNA detekteras, vilket verkar vara exklusivt för cancerceller. Tidigare kallad dubbla minuter, men nu kallad extrakromosomalt DNA (ecDNA) eftersom de vanligtvis inte är dubbletter, är dessa ecDNA-partiklar ofta mycket stora (medelstorlek 1.3 Mb), starkt förstärkt med många kopior per cell, och innehåller många gener och regulatoriska regioner, med en markant anrikning för onkogener. Det är viktigt att ecDNAs i cancerceller verkar vara mer transkriptionellt aktiva än deras kromosomala motsvarigheter och har misstänkts ge tillväxt och överlevnadsfördel till cancerceller. För närvarande är förhållandet mellan eccDNA i normala celler och ecDNA i cancer, om det finns en, inte förstått. Att vara en sådan gåtfull form av genetiskt material, ställde vi frågor om eccDNAs och ecDNAs till en panel av experter inom området som har studerat aspekter av eccDNAs och ecDNAs, allt från deras biofysiska egenskaper, produktionsmekanismer, fysiologiska roller, roller i cancerbiologi och diagnostisk potential.

Vad gör eccDNAs? Vad har varit den största överraskningen för dig om eccDNA hittills?

Anton Hensson: ecDNA är ett fordon för proto-onkogenförstärkningar i cancer. Detta har varit känt under en tid. Det som var överraskande är frekvensen av ecDNA i cancer och ecdnas förmåga att bilda mycket komplexa strukturer, inklusive delar från olika kromosomer, liksom deras förmåga att återinföra i genomet.

Paul Mischel: Jag kommer att fokusera mina kommentarer på mitt forskningsområde, ecDNA i cancer. Den största överraskningen, för mig, är vilken kritisk roll ecDNA spelar i mänsklig cancer. Våra data tyder på att ecDNA spelar en avgörande roll för att driva det aggressiva beteendet hos några av de mest maligna formerna av cancer genom minst tre interlacing mekanismer: 1) eftersom ecDNAs saknar centromerer är de föremål för icke-Mendelian (dvs nonchromosomal) arv, vilket gör det möjligt för tumörer att uppnå mycket högt onkogenkopianummer samtidigt som intratumoral genetisk heterogenitet upprätthålls; 2) den intratumorala genetiska heterogeniteten som genereras av denna arvsmekanism gör det möjligt för tumörer att utvecklas snabbt som svar på förändrade förhållanden, inklusive behandlingar, som står för den anmärkningsvärda förmågan för vissa cancerformer att ändra sina genomer i hastigheter som inte kan förklaras av kromosomal arv; 3) den höga DNA-mallnivån som uppnås genom icke-Mendelian arv och urval, i kombination med den förändrade kromatinorganisationen genererad av den cirkulära arkitekturen som vi demonstrerade (identifierad i arbete som utförts nära med Dr.Howard Chang), resulterar i massiv transkription av onkogener. Sammantaget börjar dessa funktioner förklara varför vissa cancerformer verkar genomiskt explodera och förändras, varför de inte genomgår rena selektiva svep och varför någon cell i tumören verkar kunna rekapitulera hela tumören, med sitt fulla spektrum av heterogenitet, i vissa cancertyper. Det ger också en viss inblick i varför riktade terapier mot onkogener förstärkta på ecDNA inte har varit så framgångsrika som förväntat.

Anindya Dutta: långa eccDNAs synliga i cancer genom karyotypning, även kallade dubbla minuter eller ecDNAs, har varit kända för att bära onkogener som förstärks för att främja cancer. Nya resultat tyder på att det finns en stor population av mindre eccdna, <1000 bp lång som utgör 90% av eccDNA i normala celler och cancercellinjer. Cancerceller innehåller också längre ecDNAs, inte alltid synliga genom karyotypning, som sträcker sig i storlek från 1 kb till dubbla minuter. Cirklarna som är tillräckligt långa för att innehålla fulla gener kan överuttrycka generna och förstärka dem. Detta är mycket viktigt för cancer som innehåller de långa ecDNAs. Funktionen hos de små cirklarna är oklar, men vi har visat att de kan uttrycka rna på ett avreglerat sätt och att rna bearbetas till mikroRNA och små störande RNA för att undertrycka cellulära gener.

för mig är den största överraskningen vår ursprungliga upptäckt av hur allestädes närvarande eccDNAs är, även i normala vävnader och det faktum att de flesta av dem är somatiskt mosaik (olika mellan olika celler) även i cancer. Det är först när de ger en selektiv fördel för celler, som eccDNAs som bär onkogener gör i cancer, att samma eccDNA ses i många celler i en cancer.

Birgitte Regenberg: att hitta det: 1) eccDNA är ett vanligt genetiskt element i eukaryota celler, 2) eccDNA kan uppstå från alla delar av eukaryota genom, 3) urval kan leda till samförstärkning av förstärkare och onkogener på komplex eccDNA i tumörer, 4) vissa loci verkar bilda eccDNA återkommande och med hög hastighet i jäst (CUP1 och HXT6 HXT7). Det senare resultatet är väldigt intressant, eftersom det tyder på att eccDNA kan spela en viktig roll i evolutionen genom att ge snabb anpassning till förändringar i miljön (high cupper, CUP1 och low glucose, HXT6 HXT7).

Dennis Lo: Min grupp blev först intresserad av eccDNA när vi började leta efter cirkulära DNA-molekyler i human plasma. Vår resa började med undersökningen av mitokondriellt DNA (mtDNA), som finns i en mitokondrion som en cirkulär bit DNA-molekyl på cirka 16 kb. Våra resultat visade att både cirkulära och linjära mtDNA-molekyler finns i human plasma. En överraskning från detta arbete är vår demonstration att de cirkulära mtDNA-molekylerna och linjära mtDNA-molekyler har olika vävnader av ursprung. Därför är de cirkulära mtDNA-molekylerna övervägande från det hematopoietiska systemet, medan de linjära mtDNA-molekylerna huvudsakligen kommer från levern.

vi har sedan dess utökat vårt arbete för att leta efter eccDNA i plasma. I synnerhet har vi visat att fetala eccDNA-molekyler kan detekteras i plasma hos gravida kvinnor. Vår grupp har varit intresserad i många år i storleksfördelningen av cirkulerande DNA. Det är intressant att notera att eccDNA-molekyler i moderplasma (med framträdande storlekstoppar vid 202 bp och 338 bp) har en längre storleksfördelning än linjära DNA-molekyler (modal storlek vid 166 bp). Vårt tidigare arbete med linjära DNA-molekyler i plasma visade att linjära fetala DNA-molekyler i moderplasma har en något kortare storleksfördelning än de linjära DNA-molekylerna av moderns ursprung. En annan överraskning av vårt arbete är att vi har observerat en liknande korthet av cirkulerande fetala eccDNA-molekyler jämfört med de av moderns ursprung.

Vad är din föredragna hypotes om produktionsmekanismen för eccDNAs i celler? Vilka bevis finns det för att stödja denna hypotes?

Anindya Dutta: jag tror att eccDNAs produceras som en biprodukt av DNA-reparation. Huvudbeviset för detta är att de ökas av medel som ökar DNA-skador, och vi har rapporterat att vissa DNA-reparationsgener som MSH3 (involverad i mismatch repair) krävs för att producera eccDNAs.

Birgitte Regenberg: Jag föredrar en modell där någon form av DNA-skada potentiellt kan leda till DNA-cirkularisering genom de kända DNA-reparationsmekanismerna. Detta gäller deras bildande till och med homologous recombination, microhomology och nonhomologous avslutar sammanfogning tillsammans med andra DNA-reparerar banor. De flesta av våra bevis är baserade på homologi kring den kromosomala brytpunkten som ledde till eccDNA, och jag tror att mutanta studier fortfarande krävs för att fastställa orsakssamband. Re-replication kan också producera cirkulärt DNA, vilket förklaras i den Ursprungsberoende inverterade Upprepningsförstärkningsmodellen (från Maitreya Dunham), men vi behöver fortfarande undersöka hur viktig denna mekanism är. Förutom de slumpmässiga processerna bildas några cirklar genom riktad rekombination (t-cellreceptorns excisionskretsar) och retro-transposition när lång terminal upprepning eccdna uppstår från cirkulariseringen av extrakromosomalt linjärt DNA under transpositionslivscykeln för retrotransposoner.

Anton Henssen: Baserat på publicerad litteratur och våra egna observationer tror jag att det kan finnas många olika mekanismer som bidrar till eccDNA-generationen. EccDNA kan skapas genom katastrofala omorganiseringsprocesser genom såsom kromotripsis, men det finns också andra processer med genomisk instabilitet som kan bidra till deras bildning.

Paul Mischel: återigen kommer jag att fokusera mina svar på ecDNA i cancer. Det finns en historisk syn på ecDNA-bildning, eller vid den tiden kallad dubbelminutbildning, där något händer som resulterar i avlägsnande av en DNA-sträcka från dess infödda kromosomala plats, följt av replikering och amplifiering som ecDNA. Forskare, inklusive Robert Schimke, Geoff Wahl, Nicholas Vogt och Bernard Malfoy, bland andra, bidrog till denna kunskap. De exakta molekylära mekanismerna, deras förhållande till möjliga avvikelser i DNA-skador och svarssystem, förblir ofullständigt förstådda. Det är ett område med aktiv forskning, inklusive i vårt laboratorium. Dessutom hade David Pellman och andra föreslagit att kromotripsis, som uppstår när en släpande kromosom ”fastnar”, placeras i en mikronukleus och effektivt hackas upp, kan potentiellt bilda ecDNA. Nyligen experimentellt arbete från Peter Ly och Don Cleveland, där de konstruerade en kromotriptisk Y-kromosom, antyder att kromotripsis kan resultera i ecDNA-bildning som en mekanism för genförstärkning. Därför är det mycket möjligt att flera mekanismer kan leda till ecDNA-bildning, som sedan påverkas av urval. Det kommer att vara viktigt att utveckla en djupare mekanistisk förståelse för de processer som bidrar till ecDNA-bildning.

Dennis Lo: i vårt analysarbete för storleksfördelning som involverar eccDNA-molekyler i moderplasma har vi observerat ett antal bevis på nukleosomala signaturer. Till exempel har vi observerat en periodicitet på 10 bp i storleksfördelningen i närheten av de framträdande storlekstopparna på 202 bp och 338 bp. Vår gissning är att storleken på 202 bp är ungefär den för en nukleosomkärna plus två linkers, medan storleken på 338 bp är ungefär den för två nukleosomkärnor plus två linkers. En annan anmärkningsvärd observation är att bland de mest observerade eccDNA-molekylerna i moderplasma har vi observerat fyra uppsättningar trinukleotidmotiv vid korsningen av en eccDNA-molekyl. På en sådan plats är de första och tredje motiven direkta upprepningar, medan den andra och fjärde är en annan uppsättning direkta upprepningar. Vi hoppas att dessa observationer kommer att bidra till en förbättrad förståelse av produktionsmekanismen för eccDNA. Vi förstår helt att vi inte har all information för att bygga en komplett modell men vi tror att fältet som helhet går framåt mot det.

Vad är känt om eccDNAs och cancer? På vilka sätt bidrar eccDNAs till cancercellernas maligna egenskaper?

Paul Mischel: vi har lärt oss följande: 1) ecDNAs verkar vara exklusiva för cancer, eller åtminstone har vi ännu inte sett det i normala celler, 2) ecDNAs Driver högt onkogenkopianummer och upprätthåller intratumoral genetisk heterogenitet genom sin mekanism för icke-Mendelian, nonchromosomal arv; 3) ecDNAs, på grund av denna arvsmekanism, kan ändra sina Genom snabbt, inklusive för att undvika terapier; 4) den höga DNA-mallnivån för ecDNA, i kombination med den förändrade kromatinarkitekturen, Driver massiv onkogentranskription och kan omforma epigenom på sätt som bidrar till tumörgenes.

Anton Henssen: ecDNA är inte bara ett fordon för onkogenförstärkning utan kan också bidra till genomremodellering genom dess återintegrering i det linjära genomet. Vi har visat att cirkulär DNA-återintegrering leder till störningar av funktionellt viktiga genomiska regioner och att denna störning kan bidra till många maligna egenskaper hos cancerceller.

Birgitte Regenberg: vi vet att förstärkning av ett antal onkogener på eccDNA korrelerar med cancer, och cancerpatienter med vissa eccdna-förstärkningar har dålig prognos. Överuttryck av onkogener såsom MYC och EGFR på eccDNA kommer sannolikt att omprogrammera celler och inducera tumörtillståndet.

Anindya Dutta: cirklarna i cancer är längre än i normala celler, och det har föreslagits att de får ett annat namn: ecDNAs. Vi vet nu att de är närvarande i nästan alla cancerformer men är inte tillräckligt stora för att kunna detekteras som dubbla minuter av cytogenetik. De långa ecDNAs bär kompletta gener, och när dessa gener är onkogener eller cancerdrivgener möjliggör ecDNAs deras överuttryck och förstärkning. Till exempel har ecDNAs följande onkogener: MDM2-onkogenen (som ursprungligen upptäcktes i en dubbel minut) inaktiverar p53-tumörsuppressorn, medan EGFR-onkogenen gör gliom-och glioblastomceller hyperresponsiva för EGF. Eftersom ecDNAs inte segregeras lika mellan dotterceller gör den slumpmässiga fördelningen av cirklarna mellan dotterceller det lättare för några av döttrarna att få fler kopior av cirklarna och därmed få en tillväxtfördel genom att uttrycka mer av en kodad onkogen. Således gör det icke-Mendeliska arvet av DNA-cirklarna det lättare för cancercellen att förstärka cirklar som ger cancer en tillväxtfördel.

tror du att eccDNAs kan fungera som biomarkörer för sjukdomsbedömning, på vilka sätt och hur?

Dennis Lo: jag tror att eccDNA-molekyler i plasma skulle vara en intressant riktning för biomarkörforskning. En utmaning är att deras totala koncentration verkar vara väsentligt lägre än den för linjära DNA-molekyler i plasma. Den stora storleksfördelningen av eccDNA-molekyler i plasma har en fördel att längre molekyler potentiellt skulle kunna bära mer genetisk och epigenetisk information från ursprungsvävnaden.

Anindya Dutta: vi har redan visat att eccDNAs är 1) släpps ut i blodet från tumörer och från fostret och 2) kan detekteras och kvantifieras i poolen av cellfritt cirkulerande DNA. Eftersom de är längre (medelvärde: 250 baser) än linjärt cellfritt cirkulerande DNA (medelvärde: 150 baser) och mer stabila, cirkulerande cellfria eccDNAs kan vara användbara för att detektera mutationer i onkogener (i cancer) eller för att detektera mutationer i utvecklingsviktiga gener (för icke-invasiv prenatal testning). Den längre storleken på cirklarna som ses i cancer i förhållande till normal vävnad kan också vara användbar som ett screeningsverktyg vid flytande biopsi av cancer.

Birgitte Regenberg: Ja, jag tror att eccDNA potentiellt kan fungera som en biomarkör för ett antal sjukdomar som är kopplade till mutation och genomisk omarrangering. EccDNA från t-cellreceptorgenen används redan för detektering av allvarlig kombinerad immunbristsjukdom och nya data har visat att eccDNA från ett foster kan detekteras i moderns plasma. Det verkar troligt att andra eccDNA i plasma kan fungera som markörer för övervakning av cancer, även om koncentrationen av eccDNA i plasma sannolikt kommer att begränsa.

Anton Henssen: i pediatrisk onkologi är ecDNA i form av MYCN-innehållande dubbelminutkromosomer redan en etablerad biomarkör för klinisk riskbedömning hos patienter som lider av neuroblastom. Jag tror att på samma sätt kan andra ecDNAs fungera som biomarkörer för olika sjukdomsegenskaper i många tumörenheter.

Paul Mischel: Ja, det finns betydande data som tyder på att ecDNA kan vara en biomarkör av mer aggressiva cancertyper och kan ge ny insikt om förmågan hos vissa cancerformer att utvecklas så snabbt, inklusive som svar på terapier. Det finns också tvingande skäl att tro att patienter vars cancer drivs av ecDNA kan behöva behandlas på ett annat sätt.

vilken är din favoritmetod för att analysera eccDNA och vilka är fördelarna?

Birgitte Regenberg: de flesta eccDNA finns i låga kopiantal och fångas inte av hela genomsekvensering. För att mäta både hög och låg kopia eccDNA har mitt laboratorium utvecklat metoder för att isolera, sekvensera och montera eccDNA (Circle-Seq och Circle-Map, i samarbete med L. Maretty, D. Botstein och M. Mohiyuddin). Dessa metoder tillåter oss att profilera eccDNA över genom i en given cell och tillstånd. Vi kan därmed få insikt i hur eccDNA korrelerar med ålder och sjukdom (samarbeten med J. S. Johansen och Y. Lou), och på grundnivå förstå hur de bildar, utvecklas och förgås i en population av celler.

Anindya Dutta: mitt laboratorium har mest använt rullande cirkelförstärkning av exonukleasresistenta cirklar med slumpmässiga hexamers följt av parad-end-sekvensering (Circle-Finder) för att identifiera de korsningar som är karakteristiska för cirklar. Eftersom de flesta genomikexperiment inte inkluderar rullande cirkelförstärkning kan vi inte analysera genomikdata som genereras av andra grupper för att identifiera cirklar. Nyligen har vi dock visat att analys för Transposasåtkomligt kromatin med sekvensering (billigare) eller helgenomsekvensering (mycket dyrare) kan upptäcka DNA-cirklar. Vi hoppas att dessa mer använda tekniker kommer att möjliggöra identifiering av cirklar i redan befintliga datamängder. Dessutom visar ett nyligen publicerat papper från Dennis Lo och medarbetare att cirklar kan detekteras genom matsmältning med vanliga skärbegränsningsenzymer och sekvensering av fragmenten för korsningar.

Dennis Lo: Vi skulle först behandla plasma-DNA med ett exonukleas som skulle ta bort mycket av de linjära DNA-molekylerna i provet. Sedan skulle vi skära upp cirklarna, med antingen restriktionsenzymer eller ett transposas, för att bilda linjära DNA-molekyler för vidare analys (t.ex. DNA-sekvensering). Vi tror att den transposasbaserade metoden har en fördel att, till skillnad från den restriktionsenzymbaserade metoden som kräver förekomsten av restriktionsenzymigenkänningsställe inom eccDNA-molekylen, kan transposasmetoden potentiellt verka på vilken eccDNA-molekyl som helst.

Paul Mischel: Min kollega Vineet Bafna har utvecklat ett kraftfullt verktygssats, inklusive Amplicon Architect och Amplicon Reconstructor för att analysera ecDNA-strukturen. Faktum är att pågående arbete med Dr.Bafna och Dr. Verhaak genomförs för att bättre analysera ecDNA i offentligt tillgängliga hela genomsekvenseringsdatabaser. Dessutom arbetar vi nära med kollegor Drs Howard Chang och Bing Ren, vi använder aspekter av ”epigenetiska” verktygssatsen för att karakterisera ecDNA i cancer.

Anton Henssen: Vi gillar att specifikt isolera och sekvensera ecDNA med långläst sekvensering, vilket ger möjlighet att noggrant kartlägga strukturen för ecDNA.

vilka är de forskningsfrågor relaterade till eccDNA du är mest angelägna om att utforska?

Paul Mischel: vi är mycket intresserade av att förstå ett antal kritiska frågor relaterade till ecDNA, inte listade i storleksordning. För det första, Hur bildar ecDNA och vilka är de viktigaste molekylära ”spelarna” som är involverade i bildandet? För det andra, vilka är de molekylära mekanismerna som är involverade i ecDNA-underhåll och funktion? Används olika komponenter? Används samma komponenter annorlunda? För det tredje, vilka är de kliniska konsekvenserna för patienter? Kan ecDNA användas för att berätta något viktigt om klinisk kurs? För det fjärde kan vi hitta interventionspunkter som kan användas för att utveckla nya behandlingar som hjälper patienter vars cancer drivs av ecDNA?

Anton Henssen: som läkare är jag mest angelägen om att utforska möjligheterna att använda vår förståelse för ecDNA för att hitta nya diagnostiska och terapeutiska metoder för patienter som lider av ecDNA-driven cancer.

Dennis Lo: Jag skulle vilja undersöka eccDNA: s förmåga i moderplasma för att upptäcka eller övervaka graviditetsassocierade störningar (t.ex. preeklampsi). Jag är också intresserad av att utveckla nyare och potentiellt mer omfattande metoder för eccDNA-analys. Jag är medveten om att för närvarande tillgängliga metoder kan ha viss bias i utvalda delmängder av cirkulerande eccDNA-molekyler.

Anindya Dutta: jag vill hitta funktionerna för eccDNAs som finns i normala celler. Eftersom de är så allestädes närvarande och somatiskt mosaik blir det väldigt spännande om de bidrar till intercellulär heterogenitet i normala vävnader eller bidrar till någon form av patologi. Jag vill också avgränsa vilka vägar som är involverade i bildandet av cirklarna i normala och cancerceller, i hopp om att störa dessa vägar i cancer kommer att tillåta oss att hjälpa till att rensa cancer av potentiella loci av genförstärkning och därmed hjälpa till i terapi. Slutligen vill jag se antagandet av eccDNA-sekvensering i flytande biopsier av cancer och i icke-invasiv prenatal testning av genetiska sjukdomar hos fostret.

Birgitte Regenberg: förutom att förstå hur eccDNA kan bidra till genetisk variation och utveckling av eukaryota genom, är jag angelägen om att förstå hur eccDNA bildas och upprätthålls i ett genom. Fyra faktorer kommer sannolikt att bestämma omsättningen för ett cirkulärt DNA i en celllinje: hastigheten med vilken den bildas från dess kromosomala lokus, dess förmåga att replikera, dess segregeringsläge, liksom den tillväxtfördel eller nackdel som den ger till sin värdcell. Dessutom kan eukaryota celler potentiellt ha mekanismer för att bryta ned eller utsöndra eccDNA. Detta är särskilt viktigt för meiotiska celler i flercelliga organismer, eftersom eccDNA i könslinjen kan ha stora negativa effekter i nästa generation. Nya data från jäst tyder på att meiotiska celler verkligen har utvecklat mekanismer för att sekvestrera en delmängd av eccDNA (från Auconnals laboratorium vid Berkley), och det verkar troligt att detsamma kommer att vara sant för bakterieceller i multicellulära organismer som människor.

Författarbidrag

alla författare bekräftade att de har bidragit till det intellektuella innehållet i detta dokument och har uppfyllt följande 4 krav: (a) betydande bidrag till uppfattningen och designen, förvärvet av data eller analys och tolkning av data; (B) utarbetande eller revidering av artikeln för intellektuellt innehåll, (c) slutligt godkännande av den publicerade artikeln och (d) överenskommelse om att vara ansvarig för alla aspekter av artikeln och därigenom säkerställa att frågor som rör riktigheten eller integriteten hos någon del av artikeln undersöks och löses på lämpligt sätt.

författares upplysningar eller potentiella intressekonflikter

vid inlämning av manuskript fyllde alla författare i formuläret för författarens upplysningar. Upplysningar och / eller potentiella intressekonflikter:

anställning eller ledarskap

R. W. K. Chiu, Klinisk Kemi, AACC; Ymdlo, Klinisk Kemi, AACC, DRA Limited, Take2 Holdings.

konsult eller rådgivande roll

RWK Chiu, Grail; Ymdlo, Grail, Decheng Capital; P. Mischel, Boundless Bio, Inc.

aktieägande

RWK Chiu, Grail, DRA Limited, Take2 Holdings; Ymdlo, Grail, DRA Limited, Take2 Holdings; P. Mischel, Boundless Bio, Inc.

Honoraria

ingen deklarerad.

forskningsfinansiering

R. W. K. Chiu, Grail; A. Dutta, National Institutes of Health; Y. M. D. Lo, Grail, Hong Kong Research Grants Council Theme-Based Research Scheme T12-403/15N och T12-401 / 16W.

expertutlåtanden

ingen deklarerad.

patent

RWK Chiu, PCT/CN2020 / 081066; A. Dutta, USA PPA 62832443; Ymdlo, flera patent och patentansökningar i diagnostiska tillämpningar av cellfritt DNA; P. Mischel, SD-2019-149-1, SD-2019-149-2, SD-2019-149-3.

annan ersättning

A. Dutta, Gordon Research Conference, Cold Spring Harbor Lab, BIH Academy, Shenzhen Medical School.

icke-standardiserade förkortningar

• eccDNA

  extrakromosomalt cirkulärt DNA

• ecDNA

  extrakromosomalt DNA

• mtDNA

  mitokondriellt DNA