Kromosomområden och den globala regleringen av genomet

rumslig positionering är en grundläggande princip för kärnprocesser. Kromatin är organiserad som en hierarki från nukleosomer till Mbp-kromatindomäner (CD) eller topologiskt associerande domäner (TADs) till högre nivåfack som kulminerar i kromosomområden (CT). Mikroskopiska och sekvenseringstekniker har underbyggt kromatinorganisation som en kritisk faktor som reglerar genuttryck. Till exempel, enhancers loop tillbaka för att interagera med sina målgener nästan uteslutande inom TADs, distalt placerade coregulated gener ompositionera i vanliga transkriptionsfabriker vid aktivering, och Mbp-CD-skivor uppvisar dynamisk rörelse och konfigurationsändringar in vivo. En långvarig fråga i kärnfältet är om en interaktiv kärnmatris ger en direkt koppling mellan struktur och funktion. Resultaten av icke-Random radiell positionering av CT i kärnan antyder möjligheten till förmånliga interaktionsmönster bland populationer av CT. Sekventiell märkning upp till 10 CT följt av tillämpning av datoravbildning och geometriska grafbrytningsalgoritmer avslöjade celltypsspecifika interkromosomala nätverk (ICN) av CT som förändras under cellcykeln, differentiering och cancerprogression. Det föreslås att ICN korrelerar med den globala nivån av genomreglering. Dessa tillvägagångssätt visade också att den storskaliga 3D‐topologin för CT är specifik för varje CT. Den specifika närheten av vissa kromosomala regioner i normala celler kan förklara benägenheten för distinkta translokationer i cancerundertyper. Förstå hur gener dysreguleras vid störning av kärnans normala ”ledningar” genom translokationer, borttagningar och förstärkningar som är kännetecken för cancer, bör möjliggöra mer riktade terapeutiska strategier.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.