Sekventiell isolering av kloner som bär överlappande restriktionsfragment för att spänna över ett segment av kromosom som är större än vad som kan bäras i en fag eller en kosmisk vektor. Tekniken behövs i allmänhet för att isolera en plats av intresse för vilken ingen sond är tillgänglig men som är känd för att vara kopplad till en gen som har identifierats och klonats. Denna sond används för att screena ett genombibliotek. Som ett resultat kan alla fragment som innehåller markörgenen väljas och sekvenseras. Fragmenten justeras sedan, och de segment som ligger längst bort från markörgenen i båda riktningarna subklonas för nästa steg. Dessa sonder används för att återställa genombiblioteket för att välja nya samlingar av överlappande sekvenser. När processen upprepas identifieras nukleotidsekvenserna av områden längre och längre bort från markörgenen, och så småningom kommer platsen av intresse att uppstå. Om en kromosomavvikelse är tillgänglig som skiftar en viss gen som kan fungera som en molekylär markör till en annan position på kromosomen eller till en annan kromosom, kan kromosomvandlingen flyttas till en annan position i genomet. Användningen av kromosomavvikelser i experiment av denna typ kallas kromosomhoppning. Se kronologi, 1978, Bender, Spierer och Hogness.