CodonCode Aligner-DNA sekvens montering och anpassning på Windows och Mac OS X

CodonCode Aligner är ett program för sekvens montering, contig redigering och mutation upptäckt, tillgänglig för Windows och Mac OS X. Aligner är kompatibel med Phred-Phrap och stöder fullt sekvens kvalitetsresultat, samtidigt som den erbjuder en bekant, lätt att lära användargränssnitt, som visas i följande:

Contig översikt  justering med träd Skillnadstabell  Spårvyer och Begränsningskarta

ladda ner CodonCode Aligner

CodonCode Aligner priser och beställningsinformation

köp

med CodonCode Aligner kan du:

  • importera sekvenser från textfiler
  • importera sekvenser från ABI, SCF och FASTQ filer
  • slutet klipp
  • vektor trim
  • montera contigs
  • justera till en referenssekvens
  • rikta contigs till varandra samtidigt som länkarna till spåren
  • montera eller justera i grupper, baserat på prov namn
  • hitta heterozygota mutationer
  • analysera heterozygota Infogningar och borttagningar
  • definiera regioner av intresse (”funktioner”), till exempel konsensusregioner med låg kvalitet
  • navigera snabbt mellan användardefinierade funktioner
  • generera fylogenetiska träd och begränsningskartor
  • kör Phred och Phrap direkt från Aligner-projekt
  • exportera sekvenser och funktioner
  • se skillnadstabeller och proteinöversättningar
  • Design primers
  • montera bakteriella genom och små ngs-sekvenseringsprojekt
  • hitta enzymer för RFLP-analys & skapa virtuell gel
  • analysera metylerade sekvenser & visa rå spårdata

CodonCode Aligner låter dig dra full nytta av moderna algoritmer för bassamtal och sekvensmontering, utan att tvinga dig att lära dig komplicerade kommandoradsalternativ eller Perl-programmering.

intresserad? Gå vidare och ladda ner demoversionen av CodonCode Aligner. Demoversionen är en fullt fungerande spårvisare och redaktör. Förstagångsanvändare får en automatisk 30-dagars testversion som låter dig prova alla funktioner i CodonCode Aligner.

efter nedladdning föreslår vi att du tittar på introduktionsvideoen för att bekanta dig med aligners viktigaste funktioner.

vi gör ibland rabatterade licenser tillgängliga för registrerade fans av CodonCode Aligner på Facebook-kontrollera CodonCode Aligner på Facebook för mer information!

Kodonkodaligner på Facebook

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.