skicka in…
A. Med ”klipp och klistra in”: (i) en enda sekvens i FASTA-format eller onlyplain-sekvens, eller (ii) flera sekvenser i FASTA-format.
B. en fil i FASTA-format. Skriv in sökvägen till filen direkt eller användknappen ”Bläddra” för att hitta din fil.
OBS: Klorop accepterar endast aminosyrasekvenser.
inkludera N-terminalen
det rekommenderas starkt att inkludera N-terminalen för den inlämnade sekvensen.Ju längre från N-terminalresten den inlämnade sekvensen startar, desto mersvårt och opålitligt kommer förutsägelsen att vara.
skicka helst cirka 100 rester
skicka om möjligt cirka 100 N-terminala rester. Den föreslagna längden beror på det faktum att prediktorn”cTP”/” no cTP ” utbildades med ingångssekvenserav längd 100 rester. Kortare sekvenser kan emellertid också vara tillfredsställandeförutsedd (det är viktigare att N-terminaldelen är intakt). Förutsägelsen av Cleavage-platsen är begränsad för att söka efter en potentiell klyvningsplats inom de 100 mest N-terminala resterna och påverkas i sig inte av sekvenslängd.
Sekvensnamn
namnet på sekvenserna kan vara av vilken längd som helst, men endast de första 20 tecknen kommer att bevaras under hela förutsägelsen och presenteras påchlorop prediction result page.
detaljerad utgång
markera den här rutan om du vill att neurala nätverkspoängen också för varje Residue (och inte bara för varje sekvens) ska presenteras.Ett derivat av nätverkspoängen som används för att hitta det område där Cleavage-platsen söks efter (de 40 rester som omger återstoden med den högsta derivatpoängen) presenteras också, tillsammans med klyvningsplatsen (CS-poäng) för varje Rest.