detekteringen av de dubbla rekombinanta klasserna visar att dubbla övergångar måste ske.Att veta detta kan vi fråga, är delningarna i angränsande kromosomregioner oberoende eller påverkar en crossover i en region sannolikheten för att det finns en crossover i en angränsande Region. Det visar sig att de ofta inte är oberoende: interaktionen kallas störning.
analysen kan närma sig på följande sätt. Om delningarna i de två regionerna äroberoende, då, enligt produktregeln (se sidan 37), skulle frekvensen av dubbelkombinanter vara lika med produkten av de rekombinanta frekvenserna i de intilliggande regionerna. I v-ct-cv-rekombinationsdata är V-ct RF-värdet 0,132 och värdet är 0,064, så dubbelrekombinanter kan förväntas vid frekvensen0.132 msk ct–cv0.064 = 0,0084 (0,84 procent) om det finnsoberoende. I provet av 1448 flugor förväntas 0,0084 2448 xnumx = 12 dubbla rekombinanter.Men uppgifterna visar att endast 8 faktiskt observerades. Om denna brist på dubbla rekombinanterobserverades konsekvent skulle det visa oss att de två regionerna inte är oberoende ochföreslår att fördelningen av övergångar gynnar singlar på bekostnad av dubbel. I andra ord finns det någon form av störning: en crossover minskar sannolikhetenav en crossover i en intilliggande region.
interferens kvantifieras genom att först beräkna en term som kallas sammanfallskoefficienten (c.o.c.), vilket är förhållandet mellan observerat och förväntat dubbel rekombinantersubtraheras från 1. Därför
interferens (i) = 1 − c.o.c. =
i vårt exempel
i vissa regioner finns det aldrig några observerade dubbla rekombinanter. I dessa fall, c. o. c. = 0,så I = 1 och störningar är fullständig. För det mesta är interferensvärdena som står inför kartläggning av kromosomlokaler mellan 0 och 1; men i vissa speciella situationer överstiger observerade dubblar förväntat, vilket ger negativa interferensvärden.
rekombinationsanalys är så starkt beroende av trepunktstestkorsningar och utökade versioner avdem att det är värt att göra en steg-för-steg-sammanfattning av analysen som slutar med en interferensberäkning. Vi ska använda numeriska värden från data på v, ct och cv loci.
beräkna rekombinanta frekvenser för varje par gener:
representerar länkrelationer i en länkkarta:
Bestäm de dubbla rekombinanta klasserna.
beräkna frekvensen och antalet dubbla rekombinanter som förväntas om det inte finns någoninterferens:
beräkna störningar:
du kanske har undrat varför vi alltid använder heterozygota kvinnor för testkorsningar i våra exempel på koppling i Drosophila. Närpr vg/pr+ vg+män korsas medpr vg/pr vg kvinnor, endastpr vg/pr+ vg+och pr vg / pr vg progenyåtervinnas. Detta resultat visar att det inte finns någon korsning i Drosophilamales. Denna frånvaro av korsning i ett kön är dock begränsad till vissa arter; det är inte fallet för män av alla arter (eller för heterogametiskt kön). I andra organismer finns det korsning hos XY-män och hos WZ-kvinnor. Anledningen till frånvaron avkorsning hos Drosophila-män är att de har en ovanlig profas I,utan synaptonemala komplex.
för övrigt finns det en rekombinationsskillnad mellan mänskliga kön också. Kvinnor visarhögre rekombinanta frekvenser för samma loci än män.