bokhylla

den vanligaste rapporterade sexuellt överförbara sjukdomen i USA orsakas av den parasitiska bakterien Chlamydia trachomatis. Även om cirka en halv miljon infektionsfall rapporteras årligen är en mer realistisk förekomst cirka 4 miljoner fall per år. Detta beror på att det finns en stor pool av asymptomatiska individer inom befolkningen. Om de lämnas obehandlade kan chlamydialinfektioner utvecklas till bäckeninflammatorisk sjukdom (PID) och kan också orsaka allvarlig men härdbar ögonsjukdom (trakom).

Chlamydia Genome Project consortium har nyligen sekvenserat C. trachomatis genomet. Den har en cirkulär kromosom på cirka 1 045 000 baspar, ungefär en fjärdedel av storleken på Escherichia coli. Analys av sekvensen har identifierat 888 proteinkodande gener. Bland dessa verkar vissa proteiner ha en okonventionell naturhistoria.

genomet verkar ha genomgått ett ovanligt stort antal horisontella genöverföringshändelser, vilket tyder på att den parasitiska naturen hos C. trachomatis ger större möjlighet för genöverföring att ske. Mer bisarrt, fastän, är att en del av C. trachomatis proteiner är mer relaterade till gröna växter än till andra bakterier eller deras mänskliga värdar.

FabI och FabF, två klamydiala proteiner som är involverade i fettsyrasynteskomponenten i membranbiogenes, verkar vara närmast besläktade med deras växt motsvarigheter, medan plsB, som är involverad i lipopolysackaridbiosyntes, endast har växtortologer.

hur detta kom att vara beroende av att länka två bitar av information. Först har en Klamydialiknande parasit nyligen hittats i Acanthamoeba, en fritt levande protozoan som vanligtvis finns i sötvatten eller jord men som kan förekomma som en mänsklig patogen. Kanske representerar Acanthamoeba den ursprungliga värden för klamydia och fungerade som en vektor för att överföra sin Klamydiaparasit till människor. För det andra ger slutsatser gjorda av 16S-liknande RNA bevis för att Acanthamoeba är fylogenetiskt relaterat till gröna växter. Man skulle därför förvänta sig att vissa Acanthamoeba och gröna växtgener är mycket relaterade. Horisontell överföring mellan Acanthamoeba (värd) och klamydia (parasit) kan därför ge växtliknande gener till klamydia. Om denna horisontella överföring inträffade innan klamydia överfördes till människor, är det möjligt att en mänsklig parasit har växtliknande gener.

analys av genomet av klamydia kommer att ge en utgångspunkt för en djupare förståelse av andra eukaryota parasiter, inklusive de som är ansvariga för mänsklig sjukdom.