leucemia eozinofilă cronică asociată cu PDGFRA este cauzată de mutații ale genei PDGFRA. Această afecțiune apare de obicei ca urmare a rearanjărilor genetice care fuzionează o parte a genei PDGFRA cu o parte a unei alte gene. Rareori, modificările blocurilor unice de ADN (mutații punctuale) din gena PDGFRA se găsesc la persoanele cu această afecțiune. Rearanjările genetice și mutațiile punctuale care afectează gena PDGFRA sunt mutații somatice, care sunt mutații dobândite în timpul vieții unei persoane care sunt prezente numai în anumite celule. Mutația somatică apare inițial într-o singură celulă, care continuă să crească și să se împartă, producând un grup de celule cu aceeași mutație (o populație clonală).
cea mai frecventă anomalie genetică în leucemia eozinofilă cronică asociată cu PDGFRA rezultă dintr-o ștergere a materialului genetic din cromozomul 4, care reunește o parte a genei PDGFRA și o parte a genei FIP1L1, creând gena de fuziune FIP1L1-PDGFRA.
gena FIP1L1 oferă instrucțiuni pentru o proteină care joacă un rol în formarea planurilor genetice pentru producerea proteinelor (ARN mesager sau ARNm).
gena PDGFRA oferă instrucțiuni pentru a face o proteină receptor care se găsește în membrana celulară a anumitor tipuri de celule. Proteinele receptorilor au site-uri specifice în care anumite alte proteine, numite liganzi, se potrivesc ca cheile în încuietori. Când ligandul se atașează( se leagă), proteina receptorului PDGFRA este activată (activată), ceea ce duce la activarea unei serii de proteine în mai multe căi de semnalizare. Aceste căi de semnalizare controlează multe procese celulare importante, cum ar fi creșterea și diviziunea celulară (proliferarea) și supraviețuirea celulelor.
gena de fuziune FIP1L1-PDGFRA (precum și alte gene de fuziune PDGFRA) oferă instrucțiuni pentru realizarea unei proteine de fuziune care are funcția proteinei normale PDGFRA. Cu toate acestea, proteina de fuziune nu necesită activarea legării ligandului. În mod similar, mutațiile punctuale ale genei PDGFRA pot duce la o proteină PDGFRA care este activată fără legarea ligandului. Ca urmare, căile de semnalizare sunt activate în mod constant (activate constitutiv), ceea ce crește proliferarea și supraviețuirea celulelor. Când mutația genei de fuziune FIP1L1-PDGFRA sau mutațiile punctuale ale genei PDGFRA apar în precursorii celulelor sanguine, creșterea eozinofilelor (și ocazional a altor celule sanguine, cum ar fi neutrofilele și mastocitele) este slab controlată, ducând la leucemie eozinofilă cronică asociată cu PDGFRA. Nu este clar de ce eozinofilele sunt afectate preferențial de această schimbare genetică.