trimite…
A. prin „tăiere și lipire”: (i) o singură secvență în format FASTA sau secvență onlyplain sau (ii) secvențe multiple în format FASTA.
B. un fișier în format FASTA. Introduceți calea către Fișier direct sau utilizațibutonul „Răsfoiți” pentru a găsi fișierul.
notă: Clorop acceptă numai secvențe de aminoacizi.
Include n-terminus
este recomandat să includă n-terminus a secvenței prezentate.Cu cât secvența trimisă începe mai departe de reziduul n-terminal, cu atât mai multdificilă și nesigură va fi predicția.
trimiteți de preferință aproximativ 100 de reziduuri
trimiteți, dacă este posibil, aproximativ 100 de reziduuri n-terminale. Lungimea sugerată se datorează faptului că predictorul”cTP”/” no CTP ” a fost instruit cu secvențe de intrare de lungime 100 reziduuri. Cu toate acestea, secvențele mai scurte pot fi, de asemenea, satisfăcătoare (este mai important ca partea N-terminală să fie intactă). Predicția site-ului de curățare este limitată la căutarea unui potențial site de scindare în cele mai multe 100 de reziduuri n-terminale și nu este în sine influențată de lungimea secvenței.
numele secvențelor
numele secvențelor poate fi de orice lungime, dar numai primele 20 de caractere vor fi păstrate pe tot parcursul predicției și prezentate pe pagina de rezultate a predicției clorop.
ieșire detaliată
Bifați această casetă dacă doriți ca scorul rețelei neuronale să fie prezentat și pentru fiecare reședință (și nu numai pentru fiecare secvență).Se prezintă, de asemenea, un derivat al scorului de rețea utilizat pentru găsirea zonei în care se caută situl de curățare (cele 40 de reziduuri care înconjoară reziduul cu cel mai mare scor derivat), împreună cu scorul de scindare (CS-score) pentru fiecare reziduu.