izolarea secvențială a clonelor care transportă fragmente de restricție suprapuse pentru a acoperi un segment de cromozom care este mai mare decât poate fi transportat într-un fag sau un vector cosmic. Tehnica este, în general, necesară pentru a izola un locus de interes pentru care nu este disponibilă nicio sondă, dar despre care se știe că este legată de o genă care a fost identificată și clonată. Această sondă este utilizată pentru a examina o bibliotecă de genom. Ca rezultat, toate fragmentele care conțin gena marker pot fi selectate și secvențiate. Fragmentele sunt apoi aliniate, iar acele segmente cele mai îndepărtate de gena marker în ambele direcții sunt subclonate pentru pasul următor. Aceste sonde sunt folosite pentru a rescrena biblioteca genomului pentru a selecta noi colecții de secvențe suprapuse. Pe măsură ce procesul se repetă, secvențele nucleotidice ale zonelor din ce în ce mai îndepărtate de gena marker sunt identificate și, în cele din urmă, se va întâlni locusul de interes. Dacă este disponibilă o aberație cromozomială care schimbă o anumită genă care poate servi ca marker molecular într-o altă poziție pe cromozom sau într-un alt cromozom, atunci mersul cromozomului poate fi mutat într-o altă poziție din genom. Utilizarea aberațiilor cromozomiale în experimente de acest tip este denumită sărituri cromozomiale. Vezi cronologie, 1978, Bender, Spierer și Hogness.