CodonCode Aligner-asamblare secvență ADN și aliniere pe Windows și Mac OS X

CodonCode Aligner este un program de asamblare secvență, editare contig, și de detectare a mutațiilor, disponibil pentru Windows și Mac OS X. Aligner este compatibil cu Phred-Phrap și sprijină pe deplin scoruri de calitate secvență, oferind în același timp o interfață familiară, ușor de învățat, așa cum se arată în următoarele capturi de ecran:

Contig Prezentare generală  aliniere cu arborele tabel de diferențe  vizualizări de urmărire și hartă de restricții

descărcați Cod Cod Aligner

 Cod Cod Aligner prețuri și informații de comandă

cumpara

cu CodonCode Aligner, puteți:

  • secvențe de Import din fișiere text
  • secvențe de Import de la ABI, SCF, și fișiere FASTQ
  • sfârșitul clip
  • Vector trim
  • asamblați contigs
  • aliniați la o secvență de referință
  • aliniați contigurile între ele păstrând în același timp legăturile cu urmele
  • asamblați sau aliniați în grupuri, pe baza eșantionului nume
  • găsiți mutații heterozigote
  • analizați inserțiile și ștergerile heterozigote
  • definiți regiuni de interes („caracteristici”), de exemplu regiuni de consens de calitate scăzută
  • navigați rapid între caracteristicile definite de utilizator
  • generați arbori filogenetici și hărți de restricție
  • rulați Phred și Phrap direct din proiectele Aligner
  • secvențe de Export și caracteristici
  • vedeți tabelele de diferențe și traducerile proteinelor
  • grunduri de proiectare
  • asamblați genomii bacterieni și proiectele mici de secvențiere NGS
  • găsiți enzime pentru analiza RFLP & creați gel virtual
  • analizați secvențele metilate & vizualizați datele de urmărire brute

CodonCode Aligner vă permite să profitați din plin de algoritmi moderni pentru apelarea de bază și asamblarea secvenței, fără a vă forța să învățați opțiuni complicate de linie de comandă sau programare Perl.

interesat? Mergeți mai departe și descărcați versiunea demo a CodonCode Aligner. Versiunea demo este un vizualizator complet funcțional urmă și editor. Utilizatorii pentru prima dată obține un proces automat de 30 de zile, care vă permite să încercați toate funcțiile în CodonCode Aligner.

după descărcare, vă sugerăm să urmăriți videoclipul de introducere pentru a vă familiariza cu cele mai importante caracteristici ale Aligner.

ocazional, facem licențe reduse disponibile fanilor înregistrați ai CodonCode Aligner pe Facebook-vă rugăm să verificați CodonCode Aligner pe Facebook pentru detalii!

Codoncode Aligner pe Facebook

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată.