responsabilitatea principală pentru problemele de mediu revine Departamentului de programe de mediu din Ministerul Sănătății și Biroului Național de planificare, precum și Biroului de consultanță ecologică din Ministerul bunăstării naționale și Departamentului mediului din Ministerul Afacerilor Externe.
principalele probleme de mediu ale Chile sunt defrișările și eroziunea solului rezultată și poluarea aerului, a apei și a Pământului. Poluarea aerului din industrie și transport și poluarea apei sunt deosebit de acute în centrele urbane, unde populația s-a dublat în ultimii 30 de ani. În 1996, emisiile industriale de dioxid de carbon din Chile au totalizat 48,7 milioane de tone metrice. Canalizarea netratată reprezintă o amenințare majoră pentru calitatea apei națiunii. Începând cu 2001, Chile avea 928 km cu de resurse regenerabile de apă. În timp ce 99% dintre locuitorii săi urbani au apă potabilă pură, doar 58% dintre locuitorii săi din mediul rural au același acces.
speciile pe cale de dispariție din Chile includ huemul andin de Sud, șoimul peregrin tundra, puna rhea, woodstar Chilian, gâscă cu cap roșu și broască țestoasă verde. Începând cu 2001, 16 specii de mamifere dintr-un total de 91 au fost considerate pe cale de dispariție. Din 296 de specii de păsări reproducătoare, 18 au fost amenințate cu dispariția. De asemenea, au fost amenințate patru tipuri de pești de apă dulce și 268 de specii de plante.