detectarea claselor duble recombinante arată că trebuie să apară duble încrucișări.Știind acest lucru, putem întreba, sunt crossover-urile în regiunile cromozomiale adiacente independente sau doeo încrucișare într-o regiune afectează probabilitatea de a exista o încrucișare într-o regiune adiacentăregiune. Se pare că de multe ori ele nu sunt independente: interacțiunea se numește interferență.
analiza poate fi abordată în felul următor. Dacă crossover – urile din cele două regiuni sunt independente, atunci, conform regulii produsului (a se vedea pagina 37), frecvența dublerecombinanților ar fi egală cu produsul frecvențelor recombinante din regiunile adiacente. În datele de recombinare v-ct-cv, valoarea RF v-ct este de 0,132, iar valoarea este de 0,064, astfel încât ar putea fi de așteptat dublurecombinanți la frecvența 0,132 ct–cv0,064 = 0,0084 (0,84 la sută) dacă există independență. În eșantionul de 1448 de muște, se așteaptă 0,0084 1448 = 12 recombinanți dubli.Dar datele arată că doar 8 au fost observate de fapt. Dacă această deficiență de recombinanți dubliau fost observate în mod constant, ne-ar arăta că cele două regiuni nu sunt independente șisugerează că distribuția crossover-urilor favorizează single-urile în detrimentul dublelor. Cu alte cuvinte, există un fel de interferență: un crossover reduce probabilitateaa unui crossover într-o regiune adiacentă.
interferența este cuantificată prin calcularea mai întâi a unui termen numit coeficient de coincidență (C.O.c.), care este raportul dintre recombinanții dubli observați și așteptați scăzuți din 1. Prin urmare,
interferență (I) = 1 − c.o.c. =
în exemplul nostru
în unele regiuni, nu se observă niciodată recombinanți dubli. În aceste cazuri, c. o. c. = 0,deci I = 1 și interferența este completă. De cele mai multe ori, valorile de interferență care suntîntâlnite în cartografierea locilor cromozomiale sunt cuprinse între 0 și 1; dar, în anumite situații speciale,dublele observate depășesc așteptările, dând valori de interferență negative.
analiza recombinării se bazează atât de mult pe teste în trei puncte și versiuni extinse ale acestora, încât merită să faceți un rezumat pas cu pas al analizei, terminând cu o interferență.calcul. Vom folosi valori numerice din datele de pe locii v, ct și cv.
calculați frecvențele recombinante pentru fiecare pereche de gene:
reprezintă relațiile de legătură într-o hartă de legătură:
se determină clasele duble recombinante.
calculați frecvența și numărul de recombinanți dubli așteptați dacă nu există interferențe:
calculați interferența:
s-ar putea să vă fi întrebat de ce folosim întotdeauna femele heterozigote pentru testcrosses în exemplele noastre de legătură în Drosophila. Cândpr VG / PR+ VG+masculii sunt încrucișați cupr VG / PR VG femele, numaipr vg/pr+ vg+și PR VG / PR VG progenisunt recuperate. Acest rezultat arată că nu există nici o trecere în Drosophilamales. Cu toate acestea, această absență a trecerii într-un singur sex este limitată la anumite specii; nu este cazul masculilor din toate speciile (sau pentru sexul heterogametic). În alte organisme, există încrucișare la masculii XY și la femelele WZ. Motivul pentru absențatraversarea la bărbații Drosophila este că au o profază neobișnuită i, fără complexe sinaptonemale.
de altfel, există și o diferență de recombinare între sexe. Femeile arată frecvențe recombinante mai mari pentru aceleași loci decât bărbații.