Analiza transcriptomului unicelular al celulelor mieloide derivate din celule stem CD34 + identifică o populație asemănătoare CFU-GEMM care permite infecția cu citomegalovirus uman

rezumat

celulele mieloide sunt site-uri importante ale infecției litice și latente cu citomegalovirus uman (CMV). Am arătat anterior că doar un mic subset de celule mieloide diferențiate de celulele stem hematopoietice CD34+ este permisiv replicării CMV, subliniind natura eterogenă a acestor populații. Cu toate acestea, identitatea exactă a tipurilor de celule sensibile și rezistente și caracteristicile celulare care caracterizează celulele permisive nu au putut fi disecate folosind instrumente de analiză transcripțională medie, cum ar fi microarrays și, prin urmare, au rămas enigmatice. Aici, am profilat transcriptomii de 7000 de celule individuale la o zi post-infecție folosind platforma genomică 10x. Am arătat că transcrierile virale sunt detectabile în majoritatea celulelor, sugerând că intrarea virionului este puțin probabil să fie ținta principală a mecanismelor de restricție celulară. În continuare, arătăm că replicarea virală are loc într-un subgrup mic, dar specific, de celule legate transcripțional și probabil derivate dintr – un grup de celule care exprimă markeri ai unității de formare a coloniilor-granulocite, eritrocite, monocite, megacariocite (CFU-GEMM) progenitori oligopotenți. Comparativ cu restul populației, celulele CFU-GEMM sunt îmbogățite în transcrieri cu funcții în producerea de energie mitocondrială, proliferarea celulelor, procesarea ARN și sinteza proteinelor și exprimă niveluri similare sau mai mari de gene legate de interferon. În timp ce nivelurile de Expresie ale primelor sunt menținute în celulele infectate, acestea din urmă sunt puternic reglementate. Astfel, propunem ca infecția preferențială a celulelor CFU-GEMM să se datoreze prezenței unui mediu pro-viral prestabilit, necesitând eforturi minime de optimizare din partea efectorilor virali, mai degrabă decât absenței unor factori de restricție specifici. Împreună, aceste descoperiri identifică o populație potențial nouă de celule mieloide susceptibile la replicarea CMV și oferă o posibilă justificare pentru infecția lor preferențială.

rezumat autor celulele mieloide, cum ar fi monocitele și celulele dendritice, sunt ținte critice ale infecției cu CMV. Pentru a identifica factorii celulari care conferă susceptibilitate sau rezistență la infecții, am profilat transcriptomii a 7000 de celule unice dintr-o populație de celule mieloide semi-permisive infectate cu CMV. Am descoperit că ARN-urile virale sunt detectabile în majoritatea celulelor, dar că expresia marcată a genelor litice CMV apare doar într-un mic subset de celule legate transcripțional de un grup de progenitori CFU-GEMM care exprimă cantități similare de Transcrieri care codifică factori antivirali legați de interferon ca restul populației, dar niveluri mai ridicate de Transcrieri care codifică proteinele necesare pentru producerea de energie, ARN și proteine. Astfel, concluzionăm că infecția preferențială a celulelor CFU-GEMM s-ar putea datora prezenței preexistente a unui mediu intracelular favorabil declanșării infecției, mai degrabă decât absenței factorilor antivirali care restricționează intrarea virală sau expresia genică inițială. Împreună, aceste descoperiri descoperă un nou tip de celule mieloide potențial permisive la infecția cu CMV, extind înțelegerea noastră asupra cerințelor celulare pentru inițierea cu succes a infecției cu CMV și oferă noi candidați genici pro și antivirali pentru analize viitoare și intervenții terapeutice.

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată.