pozycjonowanie przestrzenne jest podstawową zasadą rządzącą procesami jądrowymi. Chromatyna jest zorganizowana jako hierarchia od nukleosomów do domen chromatyny MBP (CD) lub domen topologicznie wiążących (TADs) do przedziałów wyższego poziomu z kulminacją w terytoriach chromosomów (CT). Techniki mikroskopowe i sekwencjonowania uzasadniły organizację chromatyny jako krytyczny czynnik regulujący ekspresję genów. Na przykład, wzmacniacze wracają do interakcji z ich genami docelowymi prawie wyłącznie w ramach TADs, dystalnie zlokalizowane koregulowane geny repozycjonują się we wspólnych fabrykach transkrypcji po aktywacji, a MBP CDs wykazują dynamiczny ruch i zmiany konfiguracyjne in vivo. Od dawna pytaniem w polu jądra jest to, czy interaktywna macierz jądrowa zapewnia bezpośredni związek między strukturą a funkcją. Wyniki badań nonrandom radial positioning of CT within the nucleus sugerują możliwość preferencyjnych wzorców interakcji między populacjami CT. Sekwencyjne etykietowanie do 10 CT, a następnie zastosowanie obrazowania komputerowego i algorytmów wydobywania Wykresów geometrycznych ujawniło specyficzne dla typu komórki sieci interchromosomalne (ICN) CT, które są zmieniane podczas cyklu komórkowego, różnicowania i progresji raka. Proponuje się korelację ICN z globalnym poziomem regulacji genomu. Metody te wykazały również, że topologia 3‐D w dużej skali CT jest specyficzna dla każdego CT. Specyficzna bliskość niektórych regionów chromosomalnych w normalnych komórkach może wyjaśniać skłonność do odrębnych translokacji w podtypach nowotworowych. Zrozumienie, w jaki sposób geny są rozregulowane po zakłóceniu normalnego „okablowania” jądra przez translokacje, delecje i amplifikacje, które są znakami rozpoznawczymi raka, powinno umożliwić bardziej ukierunkowane strategie terapeutyczne.