badanie
aby ocenić wpływ masowego podawania leków przy użyciu iwermektyny i albendazolu na eliminację filariozy limfatycznej na częstość występowania i intensywność STH, zebraliśmy próbki stolca przez okres 3 lat w 2 różnych obszarach w dystrykcie Foya (Hrabstwo Lofa) w północno-zachodniej Liberii i w dystrykcie Harper (Maryland Hrabstwo) w południowo-wschodniej Liberii (10). Zbadaliśmy pojedynczą próbkę kału na osobę za pomocą mikroskopu (powiększenie ×100) z duplikatami wymazów Kato-Katz (szablon 41 mg). Zachowaliśmy alikwoty losowo wybranych okazów na kartach FTA (GE Healthcare, Little Chalfont, Wielka Brytania) lub w RNAlater (ThermoFisher, Waltham, MA, USA) i wysłaliśmy je do Washington University School Of Medicine (St.Louis, MO, USA) do analizy przez qPCR. Dwóch doświadczonych mikroskopistów (L. G., A. T. Momolu) zbadało próbki metodą Kato-Katz smear w obu badanych obszarach. W celu wykrycia STH przez qPCR, wyodrębniliśmy DNA z ≈100 mg stolca i przetestowaliśmy go zgodnie z opisem Pilotte et al. (5) z Termocyklerem Quantstudio 6 Flex (Applied Biosystems, Carlsbad, CA, USA) i TaqMan Fast Advanced Mastermix (Applied Biosystems). Do wykrycia DNA Schistosoma mansoni wykorzystaliśmy następujące startery i sondy: forward primer 5′-TGTGGGAGTCTTGGTGTT-3′, reverse primer 5′-CAACATGACTGGGAACAGGA-3′, probe 5′-AGGTTCAGGTGG/ZEN/GTGTGTTACGAA-31abkfq-3′.
przebadaliśmy 353 próbki kału z okręgu Foya metodą Kato-Katz smear; 31 (8,8%) było pozytywnych dla A. jaj lumbricoides, 231 (65,4%) jaj tęgoryjca, 27 (7,6%) jaj podobnych do T. trichiura i 276 (78,2%) jaj S. mansoni. Przebadaliśmy 225 próbek z okręgu Harper metodą wymazu Kato-Katz; 163 (72,4%) było dodatnich dla jaj A. lumbricoides, 65 (28,9%) dla jaj tęgoryjca i 51 (22,7%) dla jaj T. trichiura (Tabela 1). Wyniki testów Kato-Katz i qPCR były zgodne dla okazów z Harpera (80,5% -91,6%), ale generalnie qPCR miał większą czułość. Nasze wyniki były zgodne z wynikami wcześniej zgłaszanymi dla próbek z innych obszarów (3,11). Zgodność pomiędzy dwoma testami diagnostycznymi dla próbek z Foya wahała się od 77,3% do 92,9%, ale czułość qPCR była nieoczekiwanie niska, co było szczególnie prawdziwe w przypadku zakażenia Ascaris i Trichuris (Tabela 1). Podczas gdy próbki dodatnie dla Ascaris Kato-Katz, ale ujemne dla qPCR, miały niską liczbę jaj, próbki dodatnie dla Trichuris Kato-Katz, ale ujemne dla qPCR miały wyższą liczbę; 7 próbek zawierało > 1000 jaj w kształcie beczki/g kału (Tabela 2). Powtórzyliśmy ekstrakcję DNA i qPCR, a także użyliśmy alternatywnego qPCR dla T. trichiura (3), ale te testy nie poprawiły zgodności między wynikami mikroskopii i qPCR.
Tabela 1
strona i gatunki | nr pozytywna * | czułość Kato-Katz, % | czułość qPCR, % | |
Foya district, n = 353 | ||||
Ascaris lumbricoides | 34 | 91.2 | 17.6 | <0.0001 |
tęgoryjec† | 247 | 93.5 | 83.4 | <0.0001 |
Trichuris trichiura | 27 | 100 | 7.4 | <0.0001 |
Schistosoma mansoni | 307 | 89.9 | 84.0 | 0.0573 |
Harper district, n = 225 | ||||
A. Inhibition | 180 | 90.6 | 98.9 | 0.0013 |
Tęgoryjec† | 99 | 65.7 | 89.9 | 0.0005 |
T. trichiura | 86 | 59.3 | 94.2 | 0.0001 |
*próbki, które uzyskały wynik dodatni w obu metodach.
†tęgoryjec był Necator americanus. Nie wykryto Ancylostoma dwunastnicy.
Tabela 2
dane demograficzne | mikroskopia, epg | qPCR, próg cyklu | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rok | liczba pacjentów | wiek, płeć | Wieś | Tt | Al | Hk | Sm | Tt | Al | Na | SM | ||
2014 | P320529 | 45 / F | 576 | 0 | 360 | 24 | Neg | Neg | 31.7 | 30.5 | |||
P320683 | 35/F | Kpombu | 12 | 0 | 0 | 0 | Negacja | Negacja | Negacja | 28.4 | |||
P320695 | 16/M | Kpombu | 24 | 0 | 0 | 72 | Negacja | Negacja | Negacja | 23.8 | |||
P320620 | 15 / M | 12 | 120 | 0 | 288 | Neg | Neg | 32.2 | 23.5 | ||||
P320746 | 9 / F | Bandenin | 24 | 0 | 0 | 0 | Neg | Neg | Neg | 26.51 | |||
P320452 | 7 / F | Felaloe | 12 | 0 | 0 | 120 | Neg | Neg | Neg | 23.9 | |||
P320596 | 6 / F | 12 | 0 | 0 | 90 | Neg | Neg | Neg | 27.6 | ||||
P320656 | 6 / F | Kpombu | 120 | 0 | 0 | 504 | Negacja | Negacja | Negacja | 21.3 | |||
2016 | P331772 | 36/M | KP | 3,048 | 0 | 12 | 24 | Negacja | Negacja | Negacja | Negacja | ||
P331921 | 35/M | Felaloe | 60 | 0 | 0 | 12 | Negacja | Negacja | Negacja | Negacja | |||
P331783 | 34 / F | KP | 420 | 0 | 0 | 0 | Negacja | Negacja | Negacja | Negacja | |||
P330724 | 26/M | Keyabendu | 4,224 | 0 | 0 | 456 | Negacja | Negacja | Negacja | 30.4 | |||
P331791 | 6 / F | KP | 12 | 0 | 156 | 12 | Negatywne | Negatywne | 33.1 | 33.4 | |||
P331962 | 6 / F | Bandenin | 12 | 0 | 0 | 168 | Neg | Neg | Neg | 29.6 | |||
P331983 | 6 / F | Bandenin | 36 | 0 | 0 | 5,304 | Neg | Neg | Neg | 28.1 | |||
2017 | P341287 | 61/M | Mendicorma | 1,464 | 0 | 0 | 0 | Negacja | Negacja | Negacja | 33.1 | ||
P341282 | 56 / M | Mendicorma | 540 | 0 | 216 | 0 | Negacja | Negacja | 28.3 | Negatywne | |||
P341284 | 50 / M | Mendicorma | 60 | 0 | 0 | 132 | Negacja | Negacja | Negacja | Negacja | |||
P342148 | 45/M | Keyabendu | 1,368 | 0 | 0 | 192 | Negacja | Negacja | 34.5 | Negatywne | |||
P340246 | 39/M | Kamatahun | 120 | 0 | 0 | 216 | Negacja | Negacja | Negacja | 30.0 | |||
P340307 | 19 / F | Bambus | 2,028 | 0 | 0 | 1,188 | Negacja | Negacja | Negacja | 24.1 | |||
P340133 | 12/M | Fokolahun | 1,020 | 16,392 | 0 | 0 | 25.3 | 16.7 | Negatywne | Negatywne | |||
P340183 | 9/F | Kpello Ndama | 72 | 0 | 0 | 0 | Negacja | Negacja | Negacja | 36.0 | |||
P341308 | 9/F | Mendicorma | 36 | 0 | 108 | 0 | Negacja | Negacja | Negacja | 28.5 | |||
P341326 | 9/M | Mendicorma | 456 | 0 | 0 | 0 | Negatywne | Negatywne | 26.5 | 30.4 | |||
P341327 | 6/M | Kłamstwo | 2,076 | 0 | 0 | 0 | Neg | Neg | Neg | Neg | |||
P340147 | 5/M | Fokolahun | 48 | 0 | 0 | 0 | 30.94 | 26.93 | Neg | Neg |
*T. zakażenie trichiura zostało potwierdzone przez qPCR tylko u 2 pacjentów, ale 25 miało jaja Capillaria w stolcu. Al, Ascaris lumbricoides; epg, jaja na gram stolca; Hk, tęgoryjec; Na, Necator americanus; Neg, negatywny; Sm, Schistosoma mansoni; Tt, T. trichiura.
aby sprawdzić, czy Kato–Katz-dodatnie, qPCR-ujemne próbki kału zawierały jaja T. trichiura, zbadaliśmy bezpośrednie rozmazy próbek kału zakonserwowanych w RNAlater za pomocą mikroskopu (powiększenie ×100 i ×400) (rysunek). Próbki z wynikiem dodatnim qPCR zawierały jaja (6 zmierzonych)o typowej morfologii T. trichiura; jaja te miały średnią (±SD) Długość 52 µm (±2,4 µm) i szerokość 25,5 µm (±1,3 µm). Natomiast próbki ujemne qPCR zawierały jaja (31 mierzonych) o średniej (±SD) długości 51,8 µm (±1,5 µm) i szerokości 32,7 µm (±2,1 µm). Próbki ujemne qPCR miały również mniej wyraźne zatyczki i grubą, prążkowaną skorupkę, cechy zgodne z jajami Capillaria hepatica (syn. Calodium hepaticum) i kilku innych gatunków Capillaria (Trichuridae). Jaja C. philippinensis lub C. aerofila, które wcześniej obserwowano w próbkach ludzkiego stolca, były mniejsze lub większe niż jaja Capillaria Znalezione w Lofa (12,13). Ze względu na to, że wtyczki biegunowe tych jaj są mniej widoczne niż u T. trichiura, a ich kształty są czasami bardziej owalne lub okrągłe, można je również pomylić z jajami A. lumbricoides za pomocą mikroskopii o małej mocy, zwłaszcza jeśli wykryto tylko kilka jaj (rysunek).
jaja robaków Znalezione w próbkach kału od osób w hrabstwie Lofa w Liberii. A, B) jaja Trichuris trichiura w próbkach z wynikiem pozytywnym dla T. trichiura metodą Kato-Katz smear i metodą qPCR. C-F) jaja Capillaria spp. w próbkach dodatnich dla T. trichiura metodą Kato-Katza rozmaz, ale ujemnych dla T. trichiura metodą qPCR. G) jajko Capillaria spp. w próbce wynik dodatni dla Ascari lumbricoides metodą Kato-Katza, ale ujemny dla A. lumbricoides metodą qPCR. H) jajo A. lumbricoides w próbce dodatniej dla A. lumbricoides przez kato-Katz rozmaz i qPCR. Paski skali wskazują 20 µm. qPCR, quantitative PCR.
członkowie podrodziny Capillaridae są pasożytami zwierząt o nieco rozbieżnych cyklach życiowych i większość z nich nie zaraża ludzi. Występują pseudoinfekcje z C. hepatica; jaja znajdujące się w stolcu są obecne, ponieważ były spożywane w zakażonej wątrobie zwierzęcej. Jednak rzeczywiste infekcje C. hepatica nie prowadzą do przechodzenia jaj w stolcu (9). Inne gatunki, takie jak C. philippinensis, powodują prawdziwe infekcje (i autoinfekcję) jajami znajdującymi się w stolcu; zakażenie jest związane ze spożywaniem surowych ryb. Nie odnotowano przypadków kapilariozy u ludzi z Liberii, a jedynie pojedyncze przypadki zostały opublikowane w Afryce Subsaharyjskiej (7-9). Przeprowadziliśmy sekwencjonowanie DNA, aby lepiej scharakteryzować Gatunek Capillaria znaleziony w Foya. Stosując startery Kt875351.1 (5′-CCCTAGTTGCGACTTTAAACGA-3′) i Capillaria 18s1r (5′- TCCACCAACTAAGAACGCC-3′), byliśmy w stanie amplifikować i sekwencjonować 288-bp porcję 18s rDNA z próbek ujemnych qPCR T. trichiura, które zawierały tylko jaja morfologicznie zidentyfikowane jako Capillaria spp. (Nr akcesyjny GenBank MG859285). Fragment DNA był w 100% identyczny z ortologami C. hepatica (accession no. MF287972.1), Aonchotheca putorii (C. putorii) (accession no. LC052356.2) i Pearsonema plica (C. plica) (nr akcesyjny MF621034.1), gatunki robaków Capillaria, które mają różne cykle życia i gatunki żywicieli, ale są tylko w 95% identyczne z ortologiem T. trichiura.
cykl życia i medyczne znaczenie gatunku Capillaria u ludzi w północno-zachodniej Liberii pozostaje do wyjaśnienia. W naszych badaniach niektórzy badani wykazali wysokie obciążenia jaj Capillaria, które mogą wskazywać na prawdziwą infekcję, a nie pseudoinfekcję. Jednak u osób z pseudoinfekcjami (7) zgłaszano przejściowe występowanie dużej liczby komórek jajowych. Podczas gdy spożycie mięsa z krzewów w Foya jest powszechne, spożycie surowych lub niedogotowanych ryb, które jest niezbędne do przenoszenia C. philippinesis, jest rzadkie.