Prześlij…
A. przez „Wytnij i wklej”: (i) pojedyncza Sekwencja w formacie FASTA lub Sekwencja onlyplain, lub (ii) wiele sekwencji w formacie FASTA.
B. plik w formacie FASTA. Wpisz ścieżkę do pliku bezpośrednio lub użyj przycisku” Przeglądaj”, aby znaleźć plik.
Uwaga: ChloroP akceptuje tylko sekwencje aminokwasowe.
Włącz N-KONIEC
zdecydowanie zaleca się włączenie N-KONIEC przedstawionej sekwencji.Im dalej od N-końcowej pozostałości zaczyna się przesyłana Sekwencja, tym bardziej trudne i zawodne będzie przewidywanie.
przedstawić korzystnie około 100 pozostałości
przedstawić, jeśli to możliwe, około 100 pozostałości N-końcowych. Sugerowana długość wynika z faktu, że predyktor „cTP”/”no CTP” był szkolony z sekwencjami wejściowymi długości 100 reszt. Jednak krótsze sekwencje mogą być również zadowalające (ważniejsze jest, aby N-końcowa część była nienaruszona). Przewidywanie miejsca rozszczepienia jest ograniczone do poszukiwania potencjalnego miejsca rozszczepienia w 100 najbardziej N-końcowych resztach i samo w sobie nie ma wpływu na długość sekwencji.
nazwy sekwencji
nazwa sekwencji może mieć dowolną długość, ale tylko pierwsze 20 znaków będzie zachowanych w całym przewidywaniu i przedstawionych na stronie wyników prognozowania.
szczegółowe dane wyjściowe
Zaznacz to pole, jeśli chcesz, aby wynik sieci neuronowej był również prezentowany dla każdej sekwencji (i nie tylko dla każdej sekwencji).Przedstawiono również pochodną wyniku sieciowego używanego do określenia obszaru, w którym poszukiwane jest miejsce rozszczepienia (40 pozostałości otaczających pozostałość z najwyższym wynikiem pochodnym), wraz z wynikiem rozszczepienia (CS-score) dla każdej pozostałości.