w 1949 roku Kluckhohn zaczął pracować wśród pięciu sąsiednich społeczności na południowym zachodzie: Zuni, Navajo, Mormon (LDS), hiszpańsko-amerykański (meksykańsko-Amerykański) i Texas Homesteaders kluczowym podejściem metodologicznym, które opracował wraz z żoną Florence Rockwood Kluckhohn i współpracownikami Evon Z. Vogt i Ethel M. Albert, między innymi, była teoria orientacji wartości. Wierzyli, że międzykulturowe zrozumienie i komunikacja mogą być ułatwione poprzez analizę orientacji danej kultury na pięć kluczowych aspektów życia ludzkiego: Natura ludzka (ludzie postrzegani jako wewnętrznie dobrzy, źli lub mieszani); relacja człowiek-Natura (pogląd, że ludzie powinni być podporządkowani naturze, dominować nad naturą lub żyć w harmonii z naturą); czas (podstawowa wartość stawiana przeszłości/tradycji, teraźniejszości/radości lub przyszłości/potomności/opóźnionej satysfakcji); aktywność (bycie, stawanie się/rozwój wewnętrzny lub robienie/dążenie/pracowitość); i relacje społeczne (hierarchiczne, uboczne/zbiorowe-egalitarne lub indywidualistyczne). Metoda orientacji wartości została opracowana przez Florence Kluckhohn i jej kolegów oraz studentów w późniejszych latach.
Kluckhohn otrzymał wiele wyróżnień w całej swojej karierze. W 1947 pełnił funkcję prezesa Amerykańskiego Towarzystwa Antropologicznego i został pierwszym dyrektorem Rosyjskiego Centrum Badawczego na Harvardzie. W tym samym roku jego książka Mirror for Man zdobyła nagrodę McGraw Hill award w kategorii best popular writing on science.
Kluckhohn początkowo wierzył w biologiczną równość ras, ale później zmienił swoje stanowisko. Kluckhohn napisał w 1959 roku, że „w świetle gromadzenia informacji o znacznym zróżnicowaniu częstości występowania zmapowanych genów wśród różnych narodów, wydaje się nierozsądne zakładanie, że „wrodzone zdolności człowieka nie różnią się w zależności od populacji”…. Przy założeniu, że specyficzne zdolności zależą od właściwości każdej puli genowej, wydaje się bardzo prawdopodobne, że populacje różnią się ilościowo w ich potencjale dla poszczególnych rodzajów osiągnięć.”
Clyde Kluckhohn zmarł na atak serca w chatce nad górną rzeką Pecos w pobliżu Santa Fe w Nowym Meksyku. Przeżył jego żona, dr Florence Rockwood Kluckhohn, która również wykładała antropologię na Harvard ’ s Department of Social Relations. Clyde Kluckhohn przeżył również jego syn, Richard Kluckhohn. Większość jego prac znajduje się na Uniwersytecie Harvarda, ale niektóre wczesne rękopisy są przechowywane na Uniwersytecie Iowa.