Sekwencyjna izolacja klonów niosących na siebie nakładające się fragmenty ograniczające, aby rozciągać się na segment chromosomu, który jest większy niż może być przenoszony w Fagu lub wektorze kosmicznym. Technika ta jest na ogół potrzebna do wyizolowania interesującego locus, dla którego nie jest dostępna żadna sonda, ale wiadomo, że jest związana z genem, który został zidentyfikowany i sklonowany. Ta sonda służy do wyświetlania biblioteki genomu. W rezultacie wszystkie fragmenty zawierające Gen markerowy mogą być wybrane i zsekwencjonowane. Fragmenty są następnie wyrównywane, a te segmenty najdalej od genu markerowego w obu kierunkach są subklonowane do następnego kroku. Sondy te są używane do ponownego sprawdzenia biblioteki genomu w celu wybrania nowych kolekcji nakładających się sekwencji. Gdy proces jest powtarzany, sekwencje nukleotydowe obszarów dalej i dalej od genu markera są identyfikowane, i ostatecznie locus zainteresowania zostaną napotkane. Jeśli dostępna jest aberracja chromosomowa, która przesuwa konkretny gen, który może służyć jako marker molekularny do innej pozycji na chromosomie lub do innego chromosomu, to chód chromosomowy może zostać przesunięty do innej pozycji w genomie. Zastosowanie aberracji chromosomowych w eksperymentach tego typu określa się mianem skoków chromosomowych. Zobacz Chronologia, 1978, Bender, Spierer i Hogness.