Kromosomområder og den globale reguleringen av genomet

Romlig posisjonering er et grunnleggende prinsipp som styrer kjernefysiske prosesser. Kromatin er organisert som et hierarki fra nukleosomer Til Mbp – kromatindomener (CD) eller topologisk assosierende domener (TADs) til rom på høyere nivå som kulminerer i kromosomområder (CT). Mikroskopiske og sekvenseringsteknikker har underbygget kromatinorganisasjon som en kritisk faktor som regulerer genuttrykk. For eksempel slår forsterkere tilbake for å samhandle med sine målgener nesten utelukkende innenfor TADs, distalt lokaliserte coregulerte gener reposisjonere til vanlige transkripsjonsfabrikker ved aktivering, Og Mbp-Cder viser dynamiske bevegelses-og konfigurasjonsendringer in vivo. Et langvarig spørsmål i kjernefeltet er om en interaktiv atommatrise gir en direkte sammenheng mellom struktur og funksjon. Funnene av ikke-tilfeldig radial posisjonering AV CT i kjernen antyder muligheten for fortrinnsrett interaksjonsmønstre blant POPULASJONER AV CT. Sekvensiell merking opp til 10 CT etterfulgt av anvendelse av datamaskinavbildning og geometriske grafgruvealgoritmer avslørte celletypespesifikke interchromosomale nettverk (ICN) AV CT som endres under cellesyklusen, differensiering og kreftprogresjon. DET foreslås AT ICN korrelerer med det globale nivået av genomregulering. Disse tilnærmingene viste også at storskala 3-D topologi AV CT er spesifikk for HVER CT. Celletypespesifikk nærhet av visse kromosomale regioner i normale celler kan forklare tilbøyelighet til distinkte translokasjoner i kreft subtyper. Å forstå hvordan gener blir dysregulert ved forstyrrelse av kjernens normale «ledninger» ved translokasjoner, slettinger og forsterkninger som er kjennetegn ved kreft, bør muliggjøre mer målrettede terapeutiske strategier.

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert.