«I en tidligere studie hadde vi foreslått at både duplikasjoner og slettinger av et lite stykke kromosom 17 og også enkeltmutasjoner alle skjedde i samme hendelse,» sa Co-første forfatter Dr. Claudia Mb Carvalho assisterende professor i molekylær og human genetikk Ved Baylor College Of Medicine. «Her brukte vi en rekke høyoppløselige teknologier og kraftige statistiske analyser for å bekrefte og utvide våre tidligere observasjoner. For å oppnå dette tok vi en nærmere titt på de genetiske endringene i dette lille stykket kromosom 17 i en stor kohorte av ikke-relaterte pasienter som presenterer Enten Potocki-Lupski eller Smith-Magenis syndrom.»
» vi fant at kohorten kan deles inn i to grupper. En gruppe inkluderer individer som har til felles de samme endringene i SAMME OMRÅDE AV DNA. Vi kaller dem gjentatte endringer fordi vi observerer gjentatte slettinger eller dupliseringer av DE samme DNA-segmentene, » sier medforfatter Dr. Christine R. Beck, en tidligere postdoktor ved Baylor som for tiden er assisterende professor Ved Institutt For Genetikk og Genomvitenskap ved University Of Connecticut Health Center og Jackson Laboratory For Genomic Medicine.
i den andre gruppen kaller forskerne det ikke-tilbakevendende, hver av pasientene hadde et annet mønster AV DNA-endringer.
«mønsteret av variasjon innen den ikke-tilbakevendende gruppen er mer kompleks enn den tilbakevendende gruppen,» Sa Beck. «Vi foreslår at ikke-tilbakevendende og tilbakevendende omarrangementer skjer ved forskjellige mekanismer.»
forskerne sammenlignet deretter de tilbakevendende og ikke-tilbakevendende prøvene angående ANTALL DNA – enkeltbaseparmutasjoner. Som referanse sammenlignet de også pasientprøver med deres respektive foreldres og med prøver fra personer uten forholdene.
» i den tilbakevendende gruppen så vi bare fire av 19 pasienter med mutasjoner i disse regionene, mens 13 av 26 pasienter i den ikke-tilbakevendende gruppen hadde mutasjoner og de skjedde med en hastighet som var 5 til 50 ganger høyere,» Sa Carvalho. «De fleste av disse mutasjonene skjedde i gener. Dette er viktig fordi denne typen mutasjoner kan bidra til sykdommen.»
» våre statistiske analyser viste at mutasjonene var helt nye hos pasientene-foreldrene bærer dem ikke. Mutasjonene forekommer også sammen med duplikasjoner eller slettinger på samme kromosom 17, og kan forekomme over en lang strekning av denne regionen, » sa Medforfatter Dr. Zeynep Coban-Akdemir, en datavitenskapsmann og genetikk og genomics postdoktoral associate of molecular and human genetics Ved Baylor.
«videre,» sa Medforfatter Xiaofei Song, en kandidatstudent i molekylær og human genetikk Ved Baylor, «våre analyser fant at et stort antall mutasjoner forekommer rundt bruddpunkter, stedene PÅ DNA hvor slettinger eller duplikasjoner finner sted, og at mutasjonene har en tendens til å være nær hverandre.»
denne studien har åpnet et vindu inn i kompleksiteten av de genetiske endringene i denne lille regionen av kromosom 17 som fører til disse to sjeldne forholdene og antyder at andre forhold som involverer duplikasjoner eller slettinger av kromosomsegmenter kan oppstå ved lignende mekanismer.
«Fire kvinnelige forskere, Claudia, Zeynep, Xiaofei og Christine, fra alle verdenshjørner (Brasil, Tyrkia, Kina Og USA) knaste ut et fantastisk stykke vitenskap og lærte oss alle mye underveis,» sa co-tilsvarende forfatter Dr. James R. Lupski, Cullen Professor I Molekylær Og Human Genetikk Ved Baylor, hovedforsker Ved Baylor Hopkins Center For Mendelian Genomics og fakultet med Baylor genetics and genomics graduate training program.