Sarah Laskey, Scientifique Produit 23andMe
La Peinture chromosomique est l’une de mes parties préférées de l’expérience 23andMe car elle regorge d’informations. Là encore, cela peut aussi être un peu intimidant car cela montre tellement de choses à la fois. Dans cet article de blog, je vais parcourir quelques bases de ce que montre votre peinture chromosomique. Et je vais vous expliquer quels types d’histoires il peut vous raconter sur votre ascendance génétique.
Qu’est-ce qu’une peinture chromosomique?
La peinture de vos chromosomes est une autre façon d’examiner les résultats de la composition de vos Ancêtres. Il montre une représentation colorée des 23 paires de chromosomes qui composent votre génome. Voici une photo de ce à quoi ressemblent les vrais chromosomes humains au microscope, côte à côte avec ma peinture sur les chromosomes:
Sur la photographie au microscope à gauche, les chromosomes sont disposés verticalement. Dans la peinture sur les chromosomes à droite, ils sont représentés sous forme de barres horizontales colorées. Sur les deux images, les chromosomes sont représentés par paires et étiquetés avec des chiffres (1 à 22) ou les lettres X et Y.
Ma peinture chromosomique a deux copies du chromosome X parce que je suis une femme. L’image de gauche montre le génome d’un mâle biologique, qui possède une copie du chromosome X et une copie du chromosome Y. Les chromosomes Y ne sont pas représentés dans les peintures chromosomiques.Dans la peinture chromosomique, les régions grises des chromosomes 13, 14, 15, 21 et 22 représentent des parties du génome où 23andMe ne teste aucun marqueur car les séquences d’ADN dans ces régions sont répétitives et difficiles à mesurer.
Exploration de votre ascendance génétique
Dans la peinture de vos chromosomes, votre génome est « peint » avec des couleurs représentant jusqu’à 31 ancêtres différents. Vous pouvez survoler ou cliquer sur les différentes ascendances de votre tableau chromosomique pour savoir où elles se trouvent dans votre génome.Les 31 populations de composition ancestrale sont organisées selon une hiérarchie qui reflète la structure génétique des populations mondiales. Par exemple, la Grande-Bretagne et l’Irlande font partie de l’Europe du Nord-Ouest, qui fait partie de l’Europe. Pour voir cette hiérarchie en action, regardez de plus près ma Peinture chromosomique: 
Ma Peinture chromosomique montre l’ascendance génétique de plusieurs populations différentes à résolution fine comme les Britanniques & Irlandais, les Français & Allemands et les Juifs ashkénazes. Mais ce sont toutes des sous-catégories d’Européens. Lorsque je clique sur « Européen » dans la barre latérale de droite, tout mon génome est coloré en « Bleu européen »:
Que pouvez-vous faire avec votre propre image haute résolution de la Composition de l’Ascendance sur chacun de vos chromosomes? Vous pouvez cliquer sur les différentes populations pour comprendre comment elles se rapportent les unes aux autres et où elles se trouvent dans votre génome. Vous pouvez également parler aux membres de votre famille (ou communiquer avec eux sur 23andMe) pour savoir quelles branches de votre famille ont contribué à quelles parties de votre ascendance génétique.
Un segment, deux segments, un segment rouge, un segment bleu
Les couleurs de votre peinture chromosomique vous renseignent sur la composition de votre ascendance, mais vous pouvez en apprendre encore plus en regardant le nombre et la longueur des segments d’ADN attribués à chaque ascendance. Tout le monde hérite de la moitié de son ADN de sa mère et de l’autre moitié de son père. Lorsque l’ADN est transmis des parents à leurs enfants, les deux chromosomes de chaque paire sont mélangés au hasard dans un processus appelé recombinaison.
Ce processus décompose de longs segments d’une seule ascendance en segments plus courts. Parfois, de très courts segments d’ascendance sont perdus lors de la recombinaison et ne sont pas transmis à la génération suivante. C’est pourquoi l’ascendance de vos lointains ancêtres n’apparaît que dans quelques courts segments de votre génome, voire pas du tout.Le terme technique pour le mélange génétique de populations précédemment séparées est adjuvant. Si vous avez différents segments d’ADN peints de différentes couleurs dans votre peinture chromosomique, ceux-ci sont la preuve d’un mélange dans votre histoire génétique. Jetez un œil à ces deux Peintures chromosomiques côte à côte:
Ces Peintures chromosomiques montrent des histoires génétiques très différentes, et pas seulement à cause de leurs Compositions Ancestrales! Même si on ignore les couleurs elles-mêmes, les deux images sont assez différentes. Les longues étendues de couleur ininterrompues à gauche témoignent d’un mélange récent, tandis que les courts segments de différentes ascendances à droite suggèrent un mélange de plusieurs générations ago.My La peinture chromosomique est celle de gauche. J’ai un grand-parent dont la famille est venue d’Allemagne, un grand-parent dont la famille est venue d’Irlande et deux grands-parents juifs ashkénazes. En d’autres termes, mes ancêtres de différentes populations européennes ont commencé à se mélanger au cours des deux ou trois dernières générations. T
la peinture chromosomique de droite montre quelqu’un qui s’identifie comme Latino (Antonio, Ingénieur chez 23andMe), dont les ancêtres amérindiens (jaune), africains (rose) et européens (bleu) ont probablement commencé à se mélanger il y a plusieurs générations.Comment pouvez-vous utiliser ces informations pour comprendre votre propre peinture chromosomique? En général, si votre ancêtre le plus récent d’une population était très récent, vous aurez des segments de cette ascendance sur plus de chromosomes, et ces segments seront plus longs que si votre ancêtre le plus récent était il y a plusieurs générations.
Merci, Maman et papa!
Si vous avez un parent ou un enfant biologique qui est également un utilisateur de 23andMe, vous pouvez vous connecter avec eux pour améliorer la résolution de vos résultats de composition d’Ascendance. La connexion avec un parent réorganisera également la peinture de votre chromosome de sorte que le chromosome supérieur de chaque paire soit celui que vous avez hérité de votre mère et le chromosome inférieur est celui que vous avez hérité de votre père.Même si vous n’êtes connecté avec aucun de vos parents via 23andMe, vous pourrez peut-être encore en apprendre un peu plus sur leur ascendance en regardant votre propre peinture chromosomique:
- Si vous êtes un homme, vous avez hérité de votre mère toutes les ascendances peintes sur votre chromosome X.
- Si vous avez la même ascendance peinte au même endroit sur les deux copies d’un chromosome, vous avez hérité de la même ascendance de vos deux parents dans cette région de votre génome.
- Si vous partagez un segment d’ADN avec un parent de l’ADN, et que vous savez si vous êtes connecté à ce parent du côté maternel ou paternel, alors vous avez hérité ce segment d’ADN (et son ascendance) du même côté de votre famille par lequel vous êtes connecté à ce parent.
- Si vos parents proviennent d’origines génétiques différentes, vous pourrez peut-être deviner de quels chromosomes vous avez hérité de lesquels de vos parents. Vous pouvez le faire en regardant les ancêtres peints sur chaque chromosome. Pour des raisons techniques, cela fonctionnera encore mieux si vous êtes connecté avec un parent. En effet, notre algorithme de calcul sera en mesure de phaser vos données brutes avec plus de précision.
Une plongée plus profonde: Niveaux de confiance
Si vous maîtrisez les détails de base de votre Peinture chromosomique et que vous souhaitez explorer à un niveau encore plus avancé, cliquez sur « Changer le niveau de confiance » et déplacez le curseur qui apparaît au-dessus de votre peinture chromosomique. Vous pouvez explorer les différentes vues de la peinture de vos chromosomes à différents niveaux de confiance. Vous pouvez également comparer ces différentes vues les unes aux autres.
L’algorithme que nous utilisons pour calculer la composition de votre Ascendance analyse un petit morceau de votre ADN à la fois. Pour chaque morceau de votre ADN, nous calculons la probabilité que ce morceau provienne de 31 populations différentes. Le curseur de confiance sur la peinture chromosomique vous permet d’explorer nos estimations de votre ascendance génétique à différents seuils de probabilité. Par exemple, si un segment de votre ADN a 55% de chances d’être japonais, alors ce segment sera peint en japonais au niveau de confiance de 50%. Mais au niveau de 60 à 90%, il sera peint avec une ascendance plus large (soit Largement Asiatique de l’Est, Largement Asiatique de l’Est & Amérindien, ou Non attribué).
Ensemble
L’histoire génétique de chacun est un peu différente. Chaque peinture chromosomique a aussi une histoire différente à raconter. Cela signifie que vous pouvez en apprendre davantage sur votre ascendance à partir de certaines des suggestions de cet article de blog que d’autres. Rappelez-vous simplement – comme toute véritable œuvre d’art, votre peinture chromosomique n’est pas quelque chose à comprendre. C’est quelque chose à explorer.
Pour une explication technique détaillée de la façon dont nous calculons votre ascendance et peignons vos chromosomes, consultez le Guide de composition de l’ascendance.