Isolement séquentiel de clones portant des fragments de restriction qui se chevauchent pour couvrir un segment de chromosome plus grand que ce qui peut être transporté dans un phage ou un vecteur cosmique. La technique est généralement nécessaire pour isoler un locus d’intérêt pour lequel aucune sonde n’est disponible mais dont on sait qu’il est lié à un gène qui a été identifié et cloné. Cette sonde est utilisée pour cribler une bibliothèque génomique. En conséquence, tous les fragments contenant le gène marqueur peuvent être sélectionnés et séquencés. Les fragments sont ensuite alignés et les segments les plus éloignés du gène marqueur dans les deux sens sont sous-clonés pour l’étape suivante. Ces sondes sont utilisées pour réexaminer la bibliothèque génomique afin de sélectionner de nouvelles collections de séquences qui se chevauchent. Au fur et à mesure que le processus se répète, les séquences nucléotidiques de zones de plus en plus éloignées du gène marqueur sont identifiées et, éventuellement, le locus d’intérêt sera rencontré. Si une aberration chromosomique est disponible qui déplace un gène particulier pouvant servir de marqueur moléculaire vers une autre position sur le chromosome ou vers un autre chromosome, la marche chromosomique peut être déplacée vers une autre position dans le génome. L’utilisation d’aberrations chromosomiques dans des expériences de ce type est appelée saut chromosomique. Voir Chronologie, 1978, Bender, Spierer et Hogness.