Soumettre…
A. par « couper et coller » : (i) une séquence unique au format FASTA ou une séquence simple, ou (ii) plusieurs séquences au format FASTA.
Fichier B. a au format FASTA. Tapez directement le chemin d’accès au fichier ou utilisezle bouton « Parcourir » pour trouver votre fichier.
REMARQUE : Le ChloroP accepte uniquement les séquences d’acides aminés.
Inclure le N-terminus
Il est fortement recommandé d’inclure le N-terminus de la séquence soumise.Plus la séquence soumise commence loin du résidu N-terminal, plus la prédiction sera difficile et peu fiable.
Soumettre de préférence environ 100 résidus
Soumettre si possible environ 100 résidus N-terminaux. La longueur suggérée est due au fait que le prédicteur « cTP » / « no cTP » a été formé avec des séquences d’entrée de résidus de longueur 100. Cependant, des séquences plus courtes peuvent également être prédites de manière satisfaisante (il est plus important que la partie N-terminale soit intacte). La prédiction du site de décollement est limitée à la recherche d’un site de clivage potentiel dans les 100 résidus les plus N-terminaux et n’est en soi pas influencée par la longueur de la séquence.
Noms de séquences
Le nom des séquences peut être de n’importe quelle longueur, mais seuls les 20 premiers caractères seront conservés tout au long de la prédiction et présentés sur la page de résultats de la prédiction Chlorop.
Sortie détaillée
Cochez cette case si vous souhaitez que le score du réseau de neurones soit également présenté pour chaque séquence (et pas seulement pour chaque séquence).Une dérivée du score de réseau utilisé pour trouver la zone dans laquelle le site de drainage est recherché (les 40 résidus entourant le résidu avec le score dérivé le plus élevé) est également présentée, ainsi que le score de sites de clivage (score CS) pour chaque résidu.