La démonstration que l’administration à long terme de doses relativement faibles de clonidine a diminué la réactivité des vaisseaux sanguins aux médicaments vasodilatateurs et vasoconstricteurs chez les animaux a conduit à son étude dans la prévention de la migraine chez l’homme. Les résultats d’essais thérapeutiques contrôlés par placebo et ouverts ont montré que la clonidine à faible dose (75 à 150 tasses par jour) est utile pour prévenir les migraines chez environ 30% à 50% des patients. Une réduction de 50% ou plus de la fréquence des céphalées ou des indices de céphalées a été rapportée chez 40% des patients dans des études contrôlées et ouvertes. Ainsi, la clonidine, comme d’autres médicaments utilisés dans le traitement par intervalles de la migraine, ne devrait être efficace que chez une proportion de patients. Bien que la clonidine n’ait pas été comparée directement à d’autres médicaments utilisés dans le traitement prophylactique de la migraine, l’impression clinique générale est qu’elle est moins efficace que le pizotifène ou le méthysergide. Parce qu’il est relativement bien toléré à des doses de 75 à 150 tasses par jour, il mérite un essai, en particulier chez les patients considérés comme nécessitant un traitement prophylactique de la migraine pour la première fois, et lorsque la migraine survient en association avec l’hypertension. Aux doses utilisées dans la prophylaxie de la migraine, qui sont presque invariablement inférieures à celles utilisées dans l’hypertension, la clonidine ne provoque pas d’hypotension et peut être utilisée chez les patients atteints de maladies cardiovasculaires. Les principaux effets secondaires sont la somnolence et la sécheresse de la bouche qui ont tendance à diminuer à mesure que le traitement se poursuit.