Le récent regain d’intérêt pour la découverte de médicaments phénotypiques a concomitamment mis l’accent sur la déconvolution cible afin d’obtenir l’identification médicament-cible. Même s’il existe des thérapies prescrites dont le mode d’action n’est pas entièrement compris, la connaissance de la cible principale facilitera inévitablement la découverte et la traduction de l’efficacité du banc au chevet du patient. L’élucidation des cibles et des voies subséquentes engagées facilitera également les études d’innocuité et le développement global de nouveaux candidats médicaments. Aujourd’hui, il existe plusieurs techniques disponibles pour identifier la cible primaire, dont beaucoup reposent sur la spectrométrie de masse (MS) pour identifier les interactions composé–protéine cible. Le test de déplacement thermique cellulaire (CETSA®) est bien adapté pour identifier l’engagement des cibles entre les ligands et leurs cibles protéiques. Plusieurs études ont montré que le CETSA combiné à la SEP est une technique puissante qui permet une déconvolution cible non marquée dans des échantillons complexes tels que des cellules et des tissus intacts en plus des lysats cellulaires et d’autres suspensions de protéines. L’applicabilité des MS CETSA aux fins de déconvolution cible sera discutée et illustrée dans cette mini-revue.