Assemblage et alignement de séquences avec Codoncode Aligner

Alignement de séquences CodonCode est un programme d’assemblage de séquences, d’édition de séquences et de détection de mutations, disponible pour Windows et Mac OS X. Alignement est compatible avec Phred-Phrap et prend entièrement en charge les scores de qualité de séquences, tout en offrant une interface utilisateur familière et facile à apprendre, comme indiqué dans les captures d’écran suivantes:

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Avec l’aligneur CodonCode, vous pouvez:

Importer des séquences à partir de fichiers texte	Importer des séquences à partir de fichiers ABI, SCF et FASTQ
Clip de fin	Trim vectoriel
Assemblez les contigs	Aligner sur une séquence de référence
Aligner les contigs les uns aux autres tout en conservant les liens vers les traces	Assembler ou aligner en groupes, en fonction de l’échantillon noms
Trouver des mutations hétérozygotes	Analyser les insertions et les suppressions hétérozygotes
Définir des régions d’intérêt ( » caractéristiques « ), par exemple des régions de consensus de faible qualité	Naviguez rapidement entre les fonctionnalités définies par l’utilisateur
Générer des arbres phylogénétiques et des cartes de restriction	Exécutez Phred et Phrap directement à partir des projets d’alignement
Exporter des séquences et des fonctionnalités	Voir les tableaux des différences et les traductions des protéines
Apprêts de conception	Assembler des génomes bactériens et de petits projets de séquençage NGS
Trouver des enzymes pour l’analyse RFLP & créer un gel virtuel	Analyser les séquences méthylées & afficher les données de trace brutes

L’aligneur CodonCode vous permet de profiter pleinement de algorithmes modernes pour l’appel de base et l’assemblage de séquences, sans vous forcer à apprendre des options de ligne de commande compliquées ou la programmation Perl.

Intéressé? Allez-y et téléchargez la version de démonstration de CodonCode Aligner. La version de démonstration est une visionneuse et un éditeur de traces entièrement fonctionnels. Les nouveaux utilisateurs bénéficient d’un essai automatique de 30 jours qui vous permet d’essayer toutes les fonctions de CodonCode Aligner.

Après le téléchargement, nous vous suggérons de regarder la vidéo d’introduction pour vous familiariser avec les fonctionnalités les plus importantes d’Aligner.FACEBOOK – Veuillez vérifier CodonCode Aligner sur Facebook pour plus de détails!

Nous mettons occasionnellement des licences à prix réduit à la disposition des fans enregistrés de CodonCode Aligner sur Facebook!

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Alignement de séquences CodonCode – Assemblage et alignement de séquences d’ADN sur Windows et Mac OS X

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