» Dans une étude précédente, nous avions proposé que des duplications et des délétions d’un petit morceau de chromosome 17 ainsi que des mutations uniques se produisaient toutes dans le même événement « , a déclaré la co-première auteure, la Dre Claudia M.B. Carvalho, professeure adjointe de génétique moléculaire et humaine au Baylor College of Medicine. « Ici, nous avons utilisé un éventail de technologies à haute résolution et de puissantes analyses statistiques pour confirmer et élargir nos observations précédentes. Pour y parvenir, nous avons examiné de plus près les modifications génétiques de ce petit morceau de chromosome 17 dans une grande cohorte de patients non apparentés présentant soit le syndrome de Potocki-Lupski, soit le syndrome de Smith-Magenis. »
» Nous avons constaté que la cohorte peut être divisée en deux groupes. Un groupe comprend des individus qui ont en commun les mêmes altérations dans la même zone de l’ADN. Nous les appelons altérations récurrentes parce que nous observons des délétions ou des duplications récurrentes des mêmes segments d’ADN « , a déclaré la co-première auteure, la Dre Christine R. Beck, un ancien boursier postdoctoral à Baylor qui est actuellement professeur adjoint au Département de génétique et de sciences du génome du Centre de santé de l’Université du Connecticut et du Jackson Laboratory for Genomic Medicine.
Dans le deuxième groupe, les chercheurs l’appellent non récurrent, chacun des patients avait un modèle différent d’altérations de l’ADN.
« Le modèle de variation au sein du groupe non récurrent est plus complexe que celui du groupe récurrent », a déclaré Beck. « Nous proposons que les réarrangements non récurrents et récurrents se produisent par différents mécanismes. »
Les chercheurs ont ensuite comparé les échantillons récurrents et non récurrents en ce qui concerne le nombre de mutations de paires de bases uniques d’ADN. À titre de référence, ils ont également comparé les échantillons des patients avec ceux de leurs parents respectifs et avec des échantillons de personnes sans conditions.
« Dans le groupe récurrent, nous n’avons vu que quatre patients sur 19 présentant des mutations dans ces régions, tandis que 13 patients sur 26 du groupe non récurrent présentaient des mutations et elles se sont produites à un taux 5 à 50 fois plus élevé », a déclaré Carvalho. « La plupart de ces mutations se sont produites dans les gènes. Ceci est important car ce type de mutations peut contribuer à la maladie. »
» Nos analyses statistiques ont montré que les mutations étaient toutes nouvelles chez les patients — les parents ne les portent pas. Les mutations se produisent également avec les duplications ou les délétions sur le même chromosome 17, et peuvent se produire sur une longue partie de cette région « , a déclaré le co-auteur, le Dr Zeynep Coban-Akdemir, informaticien et associé postdoctoral en génétique et génomique de la génétique moléculaire et humaine chez Baylor.
« De plus, » a déclaré le co-auteur Xiaofei Song, étudiant diplômé en génétique moléculaire et humaine à Baylor, « nos analyses ont révélé qu’un grand nombre de mutations se produisent autour des points de rupture, les endroits de l’ADN où les délétions ou les duplications ont lieu, et que les mutations ont tendance à être proches les unes des autres. »
Cette étude a ouvert une fenêtre sur la complexité des changements génétiques dans cette petite région du chromosome 17 qui conduisent à ces deux conditions rares et suggère que d’autres conditions impliquant des duplications ou des délétions de segments chromosomiques peuvent survenir par des mécanismes similaires.
« Quatre femmes scientifiques, Claudia, Zeynep, Xiaofei et Christine, de tous les coins du globe (Brésil, Turquie, Chine et États-Unis) ont croqué un morceau de science incroyable et nous ont beaucoup appris en cours de route », a déclaré le co-auteur correspondant, le Dr James R. Lupski, Professeur Cullen de génétique moléculaire et humaine à Baylor, chercheur principal au Baylor Hopkins Center for Mendelian Genomics et professeur au programme de formation supérieure en génétique et génomique de Baylor.