kromosomterritorier og den globale regulering af genomet

rumlig positionering er et grundlæggende princip for nukleare processer. Kromatin er organiseret som et hierarki fra nukleosomer til Mbp-kromatindomæner (CD) eller topologisk associerende domæner (TADs) til rum på højere niveau, der kulminerer i kromosomområder (CT). Mikroskopiske og sekventeringsteknikker har underbygget kromatinorganisation som en kritisk faktor, der regulerer genekspression. For eksempel slår forstærkere tilbage for at interagere med deres målgener næsten udelukkende inden for Tad ‘er, distalt lokaliserede koregulerede gener omplaceres i almindelige transkriptionsfabrikker ved aktivering, og Mbp-cd’ er udviser dynamiske bevægelses-og konfigurationsændringer in vivo. Et langvarigt spørgsmål i kernefeltet er, om en interaktiv nuklear matrice giver en direkte forbindelse mellem struktur og funktion. Resultaterne af ikke-tilfældig radial positionering af CT i kernen antyder muligheden for præferentielle interaktionsmønstre blandt populationer af CT. Sekventiel mærkning op til 10 CT efterfulgt af anvendelse af computerbilleddannelse og geometriske grafmineringsalgoritmer afslørede celletypespecifikke interchromosomale netværk (ICN) af CT, der ændres under cellecyklussen, differentiering og kræftprogression. Det foreslås, at ICN korrelerer med det globale niveau for genomregulering. Disse tilgange viste også, at den store skala 3‐D topologi af CT er specifik for hver CT. Den celletypespecifikke nærhed af visse kromosomale regioner i normale celler kan forklare tilbøjeligheden til forskellige translokationer i kræftundertyper. At forstå, hvordan gener dysreguleres ved forstyrrelse af den normale “ledning” af kernen ved translokationer, sletninger og forstærkninger, der er kendetegnende for kræft, bør muliggøre mere målrettede terapeutiske strategier.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.