Hvad er Ekstrachromosomalt cirkulært DNA, og hvad gør det?

det er kendt, at DNA i cellekernen er pakket i form af lineære kromosomer. I mange år har forskere observeret mindre længder af DNA sammen med kromosomerne, der er organiseret i cirkulære former. Nogle af disse partikler, der er blevet omtalt som ekstrachromosomalt cirkulært DNA (eccdna ‘er) eller mikrodna’ er, er typisk små (<1 kb), gen-sparsomme og ikke-amplificerede. Den samlede eccdna-overflod i celler kan være op til et par hundrede pr. eccdna-molekyler er også til stede i cirkulationen i cellefri form og giver mulighed for at tjene som blodbaserede biomarkører. I tumorer kan en anden type ekstrachromosomalt cirkulært DNA detekteres, hvilket synes at være eksklusivt for kræftceller. Tidligere omtalt som dobbelt minutter, men nu omtalt som ekstrachromosomalt DNA (ecDNA), fordi de normalt ikke er dubletter, er disse ecDNA-partikler ofte meget store (gennemsnitlig størrelse 1.3 Mb), stærkt forstærket med mange kopier pr.celle og indeholder mange gener og regulatoriske regioner med en markant berigelse for onkogener. Det er vigtigt, at ecdna ‘ er i kræftceller synes at være mere transkriptionelt aktive end deres kromosomale modstykker og har været mistænkt for at give kræftcellerne vækst og overlevelsesfordel. På nuværende tidspunkt er forholdet mellem eccDNA i normale celler og ecDNA i kræft, hvis der er en, ikke forstået. At være sådan en gådefuld form for genetisk materiale, vi stillede spørgsmål om eccdna ‘er og ecdna’ er til et panel af eksperter på området, der har studeret facetter af eccdna ‘er og ecdna’ er, lige fra deres biofysiske egenskaber, produktionsmekanismer, fysiologiske roller, roller i kræftbiologi, og diagnostisk potentiale.

Hvad gør eccDNAs? Hvad har været den største overraskelse for dig om eccDNA hidtil?

Anton Hensson: ecDNA er et middel til proto-onkogene forstærkninger i kræft. Dette har været kendt i nogen tid. Hvad der var overraskende er hyppigheden af ecDNA i kræft og ecDNA ‘ s evne til at danne meget komplekse strukturer, herunder dele fra forskellige kromosomer, samt deres evne til at genindsætte i genomet.

Paul Mischel: Jeg vil fokusere mine kommentarer på mit forskningsområde, ecDNA i kræft. Den største overraskelse for mig er, hvad en kritisk rolle ecDNA spiller i kræft hos mennesker. Vores data antyder, at ecDNA spiller en kritisk rolle i at drive den aggressive opførsel af nogle af de mest ondartede former for kræft gennem mindst tre interlacing mekanismer: 1) fordi ecdna ‘ er mangler centromerer, er de underlagt ikke-Mendelsk (dvs. nonchromosomal) arv, som gør det muligt for tumorer at opnå meget højt onkogen kopiantal, samtidig med at intratumoral genetisk heterogenitet opretholdes; 2) Den intratumorale genetiske heterogenitet genereret af denne arvsmekanisme gør det muligt for tumorer at udvikle sig hurtigt som reaktion på skiftende forhold, herunder behandlinger, der tegner sig for den bemærkelsesværdige evne for nogle kræftformer til at ændre deres genomer med hastigheder, der ikke kan forklares ved kromosomal arv; 3) det høje DNA-skabelonniveau opnået ved ikke-Mendelsk arv og udvælgelse kombineret med den ændrede kromatinorganisation genereret af den cirkulære arkitektur, som vi demonstrerede (identificeret i arbejde udført tæt sammen med Dr. Chang), resulterer i massiv transkription af onkogener. Samlet set begynder disse funktioner at forklare, hvorfor nogle kræftformer ser ud til at eksplodere og ændre sig genomisk, hvorfor de ikke gennemgår rene selektive fejninger, og hvorfor enhver celle i tumoren ser ud til at være i stand til at rekapitulere hele tumoren med sit fulde spektrum af heterogenitet i nogle kræftformer. Det giver også en vis indsigt i, hvorfor målrettede terapier mod onkogener forstærket på ecDNA ikke har været så succesrige som forventet.

Anindya Dutta: lange eccdna ‘er, der er synlige i kræftformer ved karyotyping, også betegnet dobbelt minutter eller ecdna’ er, har været kendt for at bære onkogener, der forstærkes for at fremme kræft. Nylige resultater antyder, at der er en stor population af mindre eccdna ‘ er, <1000 BP lang, der udgør 90% af eccDNA i normale celler og kræftcellelinjer. Kræftceller indeholder også længere ecdna ‘ er, ikke altid synlige ved karyotyping, som varierer i størrelse fra 1 kb til dobbelt minutter. Cirklerne, der er lange nok til at indeholde fulde gener, kan overudtrykke generne og forstærke dem. Dette er meget vigtigt for kræftformer, der indeholder de lange ecdna ‘ er. Funktionen af de små cirkler er uklar, men vi har vist, at de kan udtrykke RNA ‘er på en dereguleret måde, og at RNA’ erne behandles til mikroRNA ‘er og små interfererende RNA’ er for at undertrykke cellulære gener.

for mig forbliver den største overraskelse vores oprindelige opdagelse af, hvor allestedsnærværende eccdna ‘ erne er, selv i normale væv og det faktum, at de fleste af dem er somatisk mosaik (forskellig mellem forskellige celler) selv i kræftformer. Det er først, når de giver en selektiv fordel for celler, som eccdna ‘ er, der bærer onkogener, gør i kræftformer, at det samme eccDNA ses i mange celler i en kræft.

Birgitte Regenberg: at finde det: 1) eccDNA er et almindeligt genetisk element i eukaryote celler, 2) eccDNA kan opstå fra alle dele af eukaryote genomer, 3) selektion kan føre til co-amplifikation af forstærkere og onkogener på komplekse eccDNA i tumorer, 4) visse loci ser ud til at danne eccDNA gentagne gange og med høj hastighed i gær (CUP1 og HHV6 HHV7). Sidstnævnte resultat er virkelig interessant, fordi det antyder, at eccDNA kan spille en vigtig rolle i evolutionen ved at give hurtig tilpasning til ændringer i miljøet (høj cupper, CUP1 og lav glukose, HCT6 HCT7).

Dennis Lo: Min gruppe blev først interesseret i eccDNA, da vi begyndte at lede efter cirkulære DNA-molekyler i humant plasma. Vores rejse startede med undersøgelsen af mitokondrie-DNA (mtDNA), som findes inde i en mitokondrion som et cirkulært stykke DNA-molekyle på cirka 16 kb. Vores resultater viste, at både cirkulære og lineære mtDNA-molekyler findes i humant plasma. En overraskelse fra dette arbejde er vores demonstration af, at de cirkulære mtDNA-molekyler og lineære mtDNA-molekyler har forskellige oprindelsesvæv. Derfor er de cirkulære mtDNA-molekyler overvejende fra det hæmatopoietiske system, mens de lineære mtDNA-molekyler overvejende er fra leveren.

vi har siden udvidet vores arbejde med at lede efter eccdna i plasma. Vi har især demonstreret, at føtale eccdna-molekyler kan påvises i plasma hos gravide kvinder. Vores gruppe har i mange år været interesseret i størrelsesfordelingen af cirkulerende DNA. Det er interessant at bemærke, at eccdna-molekyler i moderplasma (med fremtrædende størrelsestoppe ved 202 bp og 338 bp) har en længere størrelsesfordeling end lineære DNA-molekyler (modal størrelse ved 166 bp). Vores tidligere arbejde med lineære DNA-molekyler i plasma viste, at lineære føtale DNA-molekyler i moderplasma har en lidt kortere størrelsesfordeling end de lineære DNA-molekyler af moderlig Oprindelse. En anden overraskelse ved vores arbejde er, at vi har observeret en lignende korthed af cirkulerende føtale eccdna-molekyler sammenlignet med dem af moderlig Oprindelse.

Hvad er din foretrukne hypotese med hensyn til produktionsmekanismen for eccdna ‘ er i celler? Hvilke beviser er der for at understøtte denne hypotese?

Anindya Dutta: jeg tror, at eccdna ‘ erne produceres som et biprodukt af DNA-reparation. Det vigtigste bevis for dette er, at de øges med stoffer, der øger DNA-skader, og vi har rapporteret, at visse DNA-reparationsgener såsom MSH3 (involveret i mismatch-reparation) er nødvendige for at producere eccdna ‘ er.

Birgitte Regenbergs: Jeg foretrækker en model, hvor enhver form for DNA-skade potentielt kan føre til DNA-cirkularisering gennem de kendte DNA-reparationsmekanismer. Dette involverer deres dannelse gennem homolog rekombination, mikrohomologi og ikke-homolog ende sammenføjning med andre DNA-reparationsveje. De fleste af vores beviser er baseret på homologi omkring det kromosomale breakpoint, der førte til eccDNA, og jeg tror, at mutantundersøgelser stadig er nødvendige for at fastslå årsagssammenhæng. Re-replikation kan også producere cirkulært DNA, som forklaret i Oprindelsesafhængig omvendt Gentagelsesforstærkningsmodel (fra Maitreya Dunham), men vi er stadig nødt til at undersøge, hvor vigtig denne mekanisme er. Udover de tilfældige processer dannes et par cirkler gennem rettet rekombination (t-cellereceptorudskæringscirklerne) og retrotransposition, når lang terminal gentagelse eccDNA stammer fra cirkularisering af ekstrachromosomalt lineært DNA under retrotransposons transpositionelle livscyklus.

Anton Henssen: Baseret på offentliggjort litteratur og vores egne observationer tror jeg, at der kan være mange forskellige mekanismer, der bidrager til eccdna generation. EccDNA kan oprettes gennem katastrofale genomomlejringsprocesser såsom chromothripsis, men der er også andre processer med genomisk ustabilitet, der kan bidrage til deres dannelse.

Paul Mischel: igen vil jeg fokusere mine svar på ecDNA i kræft. Der er et historisk syn på ecDNA-dannelse, eller på det tidspunkt kaldet dobbeltminutdannelse, hvor der sker noget, der resulterer i fjernelse af en DNA-strækning fra dens oprindelige kromosomale placering, efterfulgt af replikation og amplifikation som ecDNA. Forskere, herunder Robert Schimke, Geoff, Nicholas Vogt og Bernard Malfoy, blandt andre, bidrog til denne viden. De præcise molekylære mekanismer, deres forhold til mulige abnormiteter i DNA-skader og responssystem, forbliver ufuldstændigt forstået. Det er et område med aktiv forskning, også i vores laboratorium. Derudover havde David Pellman og andre antydet, at chromothripsis, der opstår, når et tilbagestående kromosom bliver “fast”, placeret i en mikronukleus og effektivt hugget op, potentielt kunne danne ecDNA. Nyligt eksperimentelt arbejde fra Peter Ly og Don Cleveland, hvor de konstruerede et chromothriptisk Y-kromosom, antyder, at chromothripsis kan resultere i ecDNA-dannelse som en mekanisme til genamplificering. Derfor er det meget muligt, at flere mekanismer kan føre til ecDNA-dannelse, som derefter handles ved udvælgelse. Det vil være vigtigt at udvikle en dybere mekanistisk forståelse af de processer, der bidrager til ecDNA-dannelse.

Dennis Lo: I vores størrelsesfordelingsanalysearbejde, der involverer eccDNA-molekyler i moderplasma, har vi observeret en række afslørende beviser for nukleosomale signaturer. For eksempel har vi observeret en 10 bp periodicitet i størrelsesfordelingen i nærheden af de fremtrædende størrelsestoppe på 202 bp og 338 bp. Vores formodning er, at størrelsen på 202 bp er omtrent den for en nukleosomkerne plus to linkere, mens størrelsen på 338 bp er omtrent den for to nukleosomkerner plus to linkere. En anden bemærkelsesværdig observation er, at blandt de hyppigst observerede eccDNA-molekyler i moderplasma, vi har observeret fire sæt trinukleotidmotiver på det funktionelle sted for et eccDNA-molekyle. På et sådant sted er det første og det tredje motiv direkte gentagelser, mens det andet og fjerde er et andet sæt direkte gentagelser. Vi håber, at disse observationer vil bidrage til en bedre forståelse af eccdnas produktionsmekanisme. Vi forstår fuldt ud, at vi ikke har alle oplysninger til at opbygge en komplet model, men vi mener, at feltet som helhed går videre mod det.

hvad er der kendt om eccdna ‘ er og kræft? På hvilke måder bidrager eccdna ‘ er til kræftcellernes maligne egenskaber?

Paul Mischel: vi har lært følgende: 1) ecdna ‘er ser ud til at være eksklusive for kræft, eller i det mindste har vi endnu ikke set det i normale celler, 2) ecdna’ er kører højt onkogen kopinummer og opretholder intratumoral genetisk heterogenitet gennem deres mekanisme for ikke-Mendelian, nonchromosomal arv; 3) ecdna ‘ er kan på grund af denne arvsmekanisme ændre deres genomer hurtigt, herunder for at undgå terapier; 4) det høje DNA-skabelonniveau for ecDNA kombineret med den ændrede kromatinarkitektur driver massiv onkogen transkription og kan ombygge epigenom på måder, der bidrager til tumorigenese.

Anton Henssen: ecDNA er ikke kun et middel til onkogen amplifikation, men kan også bidrage til genomomdannelse gennem dets reintegration i det lineære genom. Vi har vist, at cirkulær DNA-reintegration fører til forstyrrelse af funktionelt vigtige genomiske regioner, og at denne forstyrrelse kan bidrage til mange ondartede træk ved kræftceller.

Birgitte Regenberg: vi ved, at amplifikation af et antal onkogener på eccDNA korrelerer med kræft, og kræftpatienter med visse eccdna-amplifikationer har dårlig prognose. Overekspression af onkogener såsom MYC og EGFR på eccDNA vil sandsynligvis omprogrammere celler og inducere tumorigenisk tilstand.

Anindya Dutta: cirklerne i kræft er længere end i normale celler, og det er blevet foreslået, at de får et andet navn: ecDNAs. Vi ved nu, at de er til stede i næsten alle kræftformer, men er ikke store nok til at kunne påvises som dobbelt minutter ved cytogenetik. De lange ecdna ‘er bærer komplette gener, og når disse gener er onkogener eller kræftdrivergener, muliggør ecdna’ erne deres overekspression og amplifikation. For eksempel bærer ecdna ‘ er følgende onkogener: MDM2-onkogen (oprindeligt opdaget i et dobbelt minut) inaktiverer p53-tumorundertrykkeren, mens EGFR-onkogen gør gliom-og glioblastomceller hyperresponsive over for EGF. Fordi ecdna ‘ er ikke adskilles ligeligt mellem datterceller, gør den tilfældige fordeling af cirklerne mellem datterceller det lettere for nogle af døtrene at få flere kopier af cirklerne og dermed få en vækstfordel ved at udtrykke mere af en kodet onkogen. Således gør den ikke-Mendelske arv af DNA-cirklerne det lettere for kræftcellen at forstærke cirkler, der giver kræften en vækstfordel.

tror du, at eccdna ‘ er kunne tjene som biomarkører til sygdomsvurdering, på hvilke måder og hvordan?

Dennis Lo: jeg tror, at eccdna-molekyler i plasma ville være en interessant retning for biomarkørforskning. En udfordring er, at deres samlede koncentration ser ud til at være væsentligt lavere end for lineære DNA-molekyler i plasma. Den store størrelsesfordeling af eccdna-molekyler i plasma har en fordel, at længere molekyler potentielt ville bære mere genetisk og epigenetisk information fra oprindelsesvævet.

Anindya Dutta: vi har allerede vist, at eccdna ‘ er er 1) frigivet i blodet fra tumorer og fra fosteret og 2) kan detekteres og kvantificeres i puljen af cellefrit cirkulerende DNA. Fordi de er længere (gennemsnit: 250 baser) end lineært cellefrit cirkulerende DNA (gennemsnit: 150 baser) og mere stabile, cirkulerende cellefrie eccdna ‘ er kan være nyttige til påvisning af mutationer i onkogener (i kræftformer) eller til påvisning af mutationer i udviklingsmæssigt vigtige gener (til ikke-invasiv-prænatal test). Den længere størrelse af cirklerne set i kræft i forhold til normalt væv kan også være nyttigt som et screeningsværktøj i flydende biopsi af kræft.

Birgitte Regenberg: Ja, jeg tror, at eccDNA potentielt kan tjene som biomarkør for en række sygdomme, der er forbundet med mutation og genomisk omlægning. EccDNA fra T-cellereceptorgenet anvendes allerede til påvisning af alvorlig kombineret immundefektsygdom, og nylige data har vist, at eccDNA fra et foster kan påvises i moderens plasma. Det forekommer sandsynligt, at andre eccdna i plasma kan tjene som markører til overvågning af kræft, selvom koncentrationen af eccdna i plasma sandsynligvis vil være begrænsende.

Anton Henssen: i pædiatrisk onkologi er ecDNA i form af MYCN-indeholdende dobbeltminutkromosomer allerede en etableret biomarkør til klinisk risikovurdering hos patienter, der lider af neuroblastom. Jeg tror, at på samme måde kan andre ecdna ‘ er tjene som biomarkører for forskellige sygdomsegenskaber i mange tumorenheder.

Paul Mischel: Ja, Der er betydelige data, der tyder på, at ecDNA kan være en biomarkør for mere aggressive kræftformer og kan give ny indsigt i nogle kræfts evne til at udvikle sig så hurtigt, herunder som reaktion på terapier. Der er også tvingende grunde til at tro, at patienter, hvis kræft er drevet af ecDNA, muligvis skal behandles på en anden måde.

Hvad er din foretrukne tilgang til at analysere eccDNA, og hvad er fordelene?

Birgitte Regenberg: de fleste eccDNA findes i lave kopiantal og fanges ikke ved helgenomsekventering. For at måle både høj og lav kopi eccDNA har mit laboratorium udviklet metoder til at isolere, sekvensere og samle eccDNA i samarbejde med L. Maretty, D. Botstein og M. Mohiyuddin. Disse metoder giver os mulighed for at profilere eccDNA på tværs af genomer i en given celle og tilstand. Vi kan derved få indsigt i, hvordan eccDNA korrelerer med alder og sygdom (samarbejde med J. S. Johansen og Y. Lou), og på det grundlæggende niveau forstå, hvordan de danner, udvikler sig og fortabes i en population af celler.

Anindya Dutta: mit laboratorium har for det meste brugt rullende cirkelforstærkning af eksonukleasebestandige cirkler med tilfældige sekskamere efterfulgt af parret sekventering (Cirkelfinder) for at identificere de kryds, der er karakteristiske for cirkler. Da de fleste genomiske eksperimenter ikke inkluderer forstærkning af rullende cirkel, vi kan ikke analysere genomiske data genereret af andre grupper for at identificere cirkler. For nylig har vi imidlertid vist, at analyse for Transposase-tilgængelig kromatin ved hjælp af sekventering (billigere) eller helgenomsekventering (meget dyrere) kan detektere cirkler af DNA. Vi håber, at disse mere udbredte teknikker vil gøre det muligt at identificere cirkler i allerede eksisterende datasæt. Ud over, et nyligt papir fra Dennis Lo og kolleger, viser, at cirkler kan detekteres ved fordøjelse med almindelige skærebegrænsningssymboler og sekventering af fragmenterne til kryds.

Dennis Lo: Vi ville først behandle plasma-DNA med en eksonuklease, der ville fjerne meget af de lineære DNA-molekyler i prøven. Derefter ville vi skære cirklerne op ved hjælp af enten begrænsningssymboler eller en transposase for at danne lineære DNA-molekyler til yderligere analyse (f.eks. Vi mener, at den transposasebaserede metode har en fordel, at transposasemetoden i modsætning til den restriktionsbaserede tilgang, der kræver eksistensen af restriktionsgenkendelsessted inden for eccdna-molekylet potentielt kan virke på ethvert eccdna-molekyle.

Paul Mischel: Min kollega Vineet Bafna har udviklet et kraftfuldt værktøjssæt, herunder Amplicon Architect og Amplicon Reconstructor til at analysere ecDNA-struktur. Faktisk udføres løbende arbejde med Dr. Bafna og Dr. Verhaak for bedre at analysere ecDNA i offentligt tilgængelige helgenomsekventeringsdatabaser. Vi arbejder også tæt sammen med kollegerne Dr.Chang og Bing Ren og bruger aspekter af det “epigenetiske” værktøjssæt til at karakterisere ecDNA i kræft.

Anton Henssen: Vi vil gerne specifikt isolere og sekvensere ecDNA med langlæst sekventering, hvilket giver mulighed for nøjagtigt at kortlægge strukturen i ecDNA.

hvad er de forskningsspørgsmål relateret til eccDNA, du er mest ivrig efter at udforske?

Paul Mischel: vi er meget interesserede i at forstå en række kritiske spørgsmål relateret til ecDNA, ikke opført i rækkefølge af betydning. For det første, hvordan dannes ecDNA, og hvad er de vigtigste molekylære “spillere” involveret i dens dannelse? For det andet, hvad er de molekylære mekanismer involveret i ecDNA vedligeholdelse og funktion? Anvendes forskellige komponenter? Anvendes de samme komponenter forskelligt? For det tredje, Hvad er de kliniske konsekvenser for patienter? Kan ecDNA bruges til at fortælle os noget vigtigt om klinisk kursus? For det fjerde kan vi finde interventionspunkter, der kan bruges til at udvikle nye behandlinger, der hjælper patienter, hvis kræft er drevet af ecDNA?

Anton Henssen: som lægeforsker er jeg meget ivrig efter at undersøge mulighederne for at bruge vores forståelse af ecDNA til at finde nye diagnostiske og terapeutiske tilgange til patienter, der lider af ecDNA-drevet kræft.

Dennis Lo: Jeg vil gerne undersøge eccdnas evne til at detektere eller overvåge graviditetsassocierede lidelser (f.eks. Jeg er også interesseret i at udvikle nyere og potentielt mere omfattende tilgange til eccdna-analyse. Jeg er opmærksom på, at de nuværende tilgængelige metoder kan have en vis bias i udvalgte undergrupper af cirkulerende eccdna-molekyler.

Anindya Dutta: Jeg vil finde funktionerne i eccDNAs til stede i normale celler. Fordi de er så allestedsnærværende og somatisk mosaik, vil det være meget spændende, hvis de bidrager til intercellulær heterogenitet i normale væv eller bidrager til en form for patologi. Jeg vil også afgrænse, hvilke veje der er involveret i dannelsen af cirklerne i normale celler og kræftceller, i håb om, at indblanding i disse veje i kræft vil give os mulighed for at hjælpe med at rydde kræftformer af potentielle loci for genforstærkning og dermed hjælpe med terapi. Endelig vil jeg se vedtagelsen af eccDNA-sekventering i de flydende biopsier af kræftformer og I ikke-invasiv prænatal test af genetiske sygdomme hos fosteret.

Birgitte Regenberg: udover at forstå, hvordan eccDNA kan bidrage til genetisk variation og udvikling af eukaryote genomer, er jeg ivrig efter at forstå, hvordan eccDNA dannes og vedligeholdes i et genom. Fire faktorer vil sandsynligvis bestemme omsætningen af et cirkulært DNA i en cellelinie: den hastighed, hvormed den er dannet ud fra dens kromosomale locus, dens evne til at replikere, dens segregeringsmåde, såvel som den vækstfordel eller ulempe, den giver til sin hostingcelle. Desuden kan eukaryote celler potentielt have mekanismer til at nedbryde eller udskille eccDNA. Dette er især vigtigt for meiotiske celler i multicellulære organismer, da eccDNA i kimlinjen kan have store negative virkninger i den næste generation. Nylige data fra gær tyder på, at meiotiske celler faktisk har udviklet mekanismer til at sekvestrere en delmængde af Eccdna (fra Prisnals laboratorium i Berkley), og det forekommer sandsynligt, at det samme vil være tilfældet for kimlinjeceller i multicellulære organismer som mennesker.

Forfatterbidrag

alle forfattere bekræftede, at de har bidraget til det intellektuelle indhold af dette papir og har opfyldt følgende 4 krav: (a) væsentlige bidrag til undfangelse og design, erhvervelse af data eller analyse og fortolkning af data; (B) udarbejdelse eller revision af artiklen for intellektuelt indhold; (c) endelig godkendelse af den offentliggjorte artikel; og (d) aftale om at være ansvarlig for alle aspekter af artiklen og således sikre, at spørgsmål relateret til nøjagtigheden eller integriteten af en hvilken som helst del af artiklen undersøges og løses passende.

forfatteres oplysninger eller potentielle interessekonflikter

efter indsendelse af manuskript udfyldte alle forfattere formularen til offentliggørelse af forfattere. Oplysninger og / eller potentielle interessekonflikter:

beskæftigelse eller Ledelse

R. V. K. Chiu, klinisk kemi, AACC; Y. M. D. Lo, klinisk kemi, AACC, DRA Limited, Take2 Holdings.

konsulent eller rådgivende rolle

R. K. Chiu, Grail; Y. M. D. Lo, Grail, Decheng Capital; P. Mischel, Boundless Bio, Inc.

aktieejerskab

Chiu, Grail, Dra Limited, Take2 Holdings; Y. M. D. Lo, Grail, DRA Limited, Take2 Holdings; P. Mischel, Boundless Bio, Inc.

Honoraria

ingen erklæret.

forskningsfinansiering

R. V. K. Chiu, Gral; A. Dutta, National Institutes of Health; Y. M. D. Lo, Grail, Hong Kong Research Grants Council temabaseret Forskningsordning T12-403/15N og T12-401 / 16V.

ekspert vidnesbyrd

ingen erklæret.

patenter

R. H. K. Chiu, PCT/CN2020 / 081066; A. Dutta, USA PPA 62832443; Y. M. D. Lo, flere patenter og patentansøgninger i diagnostiske anvendelser af cellefrit DNA; P. Mischel, SD-2019-149-1, SD-2019-149-2, SD-2019-149-3.

andet vederlag

A. Dutta, Gordon Research Conference, Cold Spring Harbor Lab, BIH Academy, medicinsk skole.

ikke-standardforkortelser

• eccDNA

  ekstrachromosomalt cirkulært DNA

• ecDNA

  ekstrachromosomalt DNA

• mtDNA

  mitokondrie-DNA