disse steder giver et indblik i byens forskellige religiøse arv.
Memorial Presbyterian Church
Henry Flagler byggede den smukke Flagler Memorial Presbyterian Church i 1889 for at ære hans afdøde datter Jennys liv. Den venetianske renæssance-stil kirke har udsøgte arkitektoniske detaljer, herunder indviklede terracotta friser af italienske kunstnere, håndskårne Santo Domino mahogni og en massiv kobber kuppel. Flagler såvel som hans datter, barnebarn og første kone er begravet i det tilstødende mausoleum. Ture på dette historiske sted på 32 Sevilla Street gør det muligt for besøgende at se industriens rørende hyldest til sin datter.
Ancient City Baptist Church
atten chartermedlemmer organiserede Ancient City Baptist Church den 20.januar 1887. Med et normannisk tårn og ovale farvede glasvinduer blev tan brick romansk Revival-stil helligdom dedikeret ni år senere på en pakke jord på 27 Sevilla Street. Doneret af Henry Flagler indeholdt jordtilskuddet bestemmelser om, at Menigheden opførte et gældsfrit tilbedelseshus, der kostede ikke mindre end $10.000, der aldrig ville have en klokke i tårnet. Menigheden mødte den gældfri udfordring, da de byggede bygningen uden en klokke til en endelig pris på lidt over $14.345.
Grace United Methodist Church
i 1887 hyrede Henry Flagler de samme håndværkere, der konstruerede sit Ponce de Leon-Hotel til at opføre Grace United Methodist Church. Den spanske renæssance Revival-stil fristed med sin terracotta spir og lister er en varig påmindelse om den indflydelse, som Spanien har haft på byen. Bygningen var en erstatning for den træramme Olivet Methodist Church, der besatte en anden grund, som Flagler ønskede for sit overdådige Hotel. Beliggende på 8 Carrera Street, blev kirken noteret på National Register of Historic Places i 1979.
Cathedral Basilica of St. Augustine
Cathedral Basilica of St. Augustine er det ældste katolske hus for tilbedelse i byen. Grundlagt i 1565 var sognet omdrejningspunktet for det katolske samfund gennem byens tidlige udforskning, piratdominans og udvikling af Henry Flagler. Med spansk Mission og neoklassisk arkitektonisk stil blev den nuværende bygning afsluttet i 1797. Inspireret af dens spanske koloniale rødder er kirkens indvendige vægge prydet med vægmalerier, der skildrer katolicismens historie i den nye verden. De farvede glasvinduer illustrerer livet for St. Augustine of Hippo, som kirken er opkaldt efter. Basilikaen, der ligger på 38 Cathedral Place, blev føjet til National Register of Historic Places i 1970.
Nombre de Dios Mission
rødderne til Nombre de Dios Mission sporer til etableringen af byen i 1565. Da Pedro menendes de Aviles landede i St. Augustine den 8. September det år, hævdede han landet for Spanien og kirken. Det var på dette sted, at ekspeditionens præst Francisco Lopes fejrede den første sognemesse. Den fredfyldte indstilling på 27 Ocean Avenue inkluderer en statue af Lopes, Fredsprinsen Kirke og et arkæologisk sted samt det rustikke Alter, Vor Frue af Guadalupe Helligdom og det store kors. Stigende 208 fod, rustfrit stålkors, opført i 1965, fejrer 400-årsdagen for den første gudstjeneste.
Helligdom for Vor Frue af La Leche
beliggende på 27 Ocean Avenue, Helligdommen for Vor Frue af La Leche er den første i USA, der er dedikeret til Maria, Jesu mor. Kapellet blev etableret i 1615 og huser en elegant detaljeret udskåret statue af den velsignede jomfru, der ammer barnet. Mange pilgrimme rejser her for at bede om velsignelser på vegne af mødre og fremtidige mødre.
St. Photios græske Helligdom
beliggende på historiske St. George Street, helligdommen er dedikeret til Amerikas første græske enklave, som ankom i Amerika i 1768. Den karakteristiske helligdom er prydet med smukke vægmalerier i Bysantinsk stil med 22 karat guldblad, der skildrer forskellige apostle og helgener i den kristne kirke. Udstillinger, artefakter og historiske memorabilia krønike livet for disse tidlige græske bosættere.
St. Cyprian Church
St. Cyprian Episcopal Church blev grundlagt i 1893 og var oprindeligt et sikkert sted for tilbedelse for afroamerikanere under tiden efter borgerkrigen, før borgerlige rettigheder. Bygget i 1900 på det, der nu er 37 Lovett Street i kvarteret Lincolnville, Carpenter gotisk stil kirke ærer St. Cyprian, en nordamerikansk helgen, hvis arbejde svarede til St. Augustine. Partiet og byggeomkostningerne blev betalt af Emma Hvid, et velhavende medlem af den hvide søsterkirke, Trinity Parish. Hun blev kaldet til at handle efter at have indset, at Menigheden tilbad i medlemmernes hjem.
St. Benedict the Moor Church
ære skytshelgen for afroamerikanere, St. Benedict the Moor Catholic Church blev indviet i 1911. Kirken har spillet en central rolle i byens afroamerikanske historie. Tre hvide søstre af det velsignede sakrament, der underviste på sogneskolen, blev arresteret i 1916 for at uddanne sorte børn. Martin Luther King, Jr. brugte præstegården som et sted at planlægge borgerrettighedsdemonstrationer i området. Redbrick Spanish Mission-Style edifice ligger på 86 M L King Avenue.
Trinity Episcopal Church
oprettet i 1821, Trinity Episcopal Church på 215 St. George Street er den ældste protestantiske menighed i Florida. Oprindeligt bygget af kokina i 1830 blev helligdommen renoveret og udvidet i begyndelsen af 1900 ‘ erne. Den korsformede neo-gotiske kirke har farvede glasvinduer, herunder triptykonet over alteret, som blev lavet af Louis Tiffany, Henry Payne og Mayer Company.