clostridier er Gram-positive, anaerobe, endospore-dannende bakterier, ude af stand til ulige sulfatreduktion. Slægten Clostridium består af cirka 180 arter og er en af de største bakterieslægter. Fysiologi er for det meste afsat til syreproduktion. Talrige veje er kendt, såsom homoacetatfermentering ved acetogener, propionatfermenteringen ved Clostridium propionicum og butyrat/butanolfermenteringen ved C. acetobutylicum, en velkendt opløsningsmiddelproducent. Clostridia nedbryder sukkerarter, alkoholer, aminosyrer, puriner, pyrimidiner og polymerer såsom stivelse og cellulose. Energibesparelse kan udføres ved phosphorylering på substratniveau såvel som ved dannelse af iongradienter. Endospore dannelse ligner mekanismen belyst i Bacillus. Morfologi, indhold og egenskaber af sporer ligner meget baciller endosporer. Sporulerende clostridier danner normalt hævede moderceller og akkumulerer opbevaringsstoffet granulose. Clostridial sporulation adskiller sig imidlertid ved ikke at anvende det såkaldte phosphorelay. Initiering starter ved direkte phosphorylering af master regulator Spo0A.kaskaden af sporulationsspecifikke Sigma-faktorer er igen identisk med det, der er kendt fra Bacillus. Begyndelsen af sporulation er koblet i nogle arter til enten opløsningsmiddel (acetone, butanol) eller toksin (f.eks. C. perfringens enterotoksin) dannelse. Spiring af sporer induceres ofte af forskellige aminosyrer, ofte i kombination med fosfat og natriumioner. I medicinske anvendelser anvendes C. butyricum sporer som en C. difficile profylakse og som behandling mod diarre. Rekombinante sporer undersøges og testes i øjeblikket som antitumormidler, fordi de kun spirer i hypoksiske væv (dvs.tumorvæv), hvilket muliggør præcis målretning og direkte drab af tumorceller.