i 1949 begyndte Kluckhohn at arbejde blandt fem tilstødende samfund i sydvest: Sun, Navajo, Mormon (LDS), spansk-amerikansk (Meksikansk-amerikansk) og husmænd en vigtig metodologisk tilgang, som han udviklede sammen med sin kone Florence Kluckhohn og kolleger Evon Vogt og Ethel M. Albert, blandt andre, var værdier Orienteringsteori. De mente, at tværkulturel forståelse og kommunikation kunne lettes ved at analysere en given kulturs orientering til fem centrale aspekter af menneskelivet: Menneskelig natur (mennesker set som iboende gode, onde eller blandede); forholdet mellem menneske og natur (synspunktet om, at mennesker skal være underordnet naturen, dominerende over naturen eller leve i harmoni med naturen); tid (primær værdi placeret på fortid/tradition, nutid/nydelse eller fremtid/eftertiden/forsinket tilfredsstillelse); aktivitet (at være, blive/indre udvikling eller gøre/stræbe/flittighed); og sociale relationer (hierarkisk, sikkerhedsstillelse/kollektiv-egalitær eller individualistisk). Metoden værdier orientering blev udviklet længst af Florence Kluckhohn og hendes kolleger og studerende i de senere år.
Kluckhohn modtog mange hædersbevisninger gennem hele sin karriere. I 1947 fungerede han som præsident for American Anthropological Association og blev første direktør for det russiske Forskningscenter ved Harvard. I samme år vandt hans bog Mirror for Man prisen for bedste populære skrivning om videnskab.
Kluckhohn troede oprindeligt på racernes biologiske lighed, men vendte senere sin position. Kluckhohn skrev i 1959, at “i lyset af akkumulerende information om signifikant varierende forekomst af kortlagte gener blandt forskellige folkeslag synes det uklogt at antage fladt, at ‘menneskets medfødte kapacitet ikke varierer fra en befolkning til en anden’…. På den forudsætning, at specifikke kapaciteter påvirkes af egenskaberne af hver genpool, forekommer det meget sandsynligt, at populationer adskiller sig kvantitativt i deres potentialer for bestemte former for præstation.”
Clyde Kluckhohn døde af et hjerteanfald i en hytte ved den øvre Pecos-flod nær Santa Fe. Han blev overlevet af sin kone, Dr. Florence Kluckhohn, der også underviste i antropologi ved Harvards afdeling for sociale relationer. Clyde Kluckhohn blev også overlevet af sin søn, Richard Kluckhohn. De fleste af hans papirer afholdes på Harvard University, men nogle tidlige manuskripter opbevares ved Universitetet i Iova.