Indsend…
A. Ved “klip og indsæt”: (i) en enkelt sekvens i FASTA-format eller onlyplain-sekvens eller (ii) flere sekvenser i FASTA-format.
B. en fil i FASTA-format. Indtast stien til filen direkte eller brugknappen “Gennemse” for at finde din fil.
Bemærk: ChloroP accepterer kun aminosyresekvenser.
Inkluder N-terminalen
det anbefales kraftigt at inkludere N-terminalen for den indsendte sekvens.Jo længere fra Den N-terminale rest den indsendte sekvens starter, jo merevanskelig og upålidelig forudsigelsen vil være.
Indsend fortrinsvis omkring 100 restkoncentrationer
Indsend om muligt omkring 100 N-terminale restkoncentrationer. Den foreslåede længde skyldes, at” CTP ” / “no cTP” – forudsigeren blev trænet med inputsekvenseraf længde 100 rester. Kortere sekvenser kan dog også være tilfredsstillende. forudsagt (det er vigtigere, at den N-terminale del er intakt). Forudsigelsen af prøvningsstedet er begrænset til at søge efter et potentielt spaltningssted inden for de 100 mest N-terminale rester og påvirkes i sig selv ikke af sekvenslængden.
Sekvensnavne
navnet på sekvenserne kan være af en hvilken som helst længde, men kun de første 20tegn bevares i hele forudsigelsen og præsenteres på siden med forudsigelsesresultat.
detaljeret output
Marker dette felt, hvis du ønsker, at det neurale netværks score også for hver restue (og ikke kun for hver sekvens) skal præsenteres.Et derivat af netscoren, der bruges til at finde det område, hvor der søges efter søgestedet (de 40 rester, der omgiver restkoncentrationen med den højeste afledte score), præsenteres også sammen med spaltningssitescore (CS-score) for hver rest.