påvisningen af de dobbelte rekombinante klasser viser, at dobbelt crossovers skal forekomme.At vide dette, kan vi spørge, er crossovers i tilstødende kromosomregioner uafhængige eller doesa crossover i en region påvirker sandsynligheden for, at der er en crossover i en tilstødende region. Det viser sig, at de ofte ikke er uafhængige: interaktionen kaldes interferens.
analysen kan kontaktes på følgende måde. Hvis crossovers i de to regioner eruafhængige, vil frekvensen af dobbeltkombinanter ifølge produktreglen (se side 37) svare til produktet af de rekombinante frekvenser i de tilstødende regioner. I V–ct-cv-rekombinationsdata er V-ct RF-værdien 0,132, og værdien er 0,064, så der kan forventes dobbeltkombinanter ved frekvensen0.132 liter ct–cv0.064 = 0,0084 (0,84 procent), hvis der eruafhængighed. I stikprøven på 1448 fluer forventes 0,0084 liter 1448 = 12 dobbeltrekombinanter.Men dataene viser, at kun 8 faktisk blev observeret. Hvis denne mangel på dobbeltrekombinanter blev konsekvent observeret, ville det vise os, at de to regioner ikke er uafhængige ogforeslår, at fordelingen af crossovers favoriserer singler på bekostning af Double. Med andre ord er der en form for interferens: en crossover reducerer sandsynlighedenaf en crossover i en tilstødende region.
interferens kvantificeres ved først at beregne et udtryk kaldet tilfældighedskoefficienten (c.o.c.), som er forholdet mellem observeret og forventet dobbelt rekombinantersubtrukket fra 1. Derfor
interferens (I) = 1 − c.o.c. =
i vores eksempel
i nogle regioner er der aldrig nogen observerede dobbeltrekombinanter. I disse tilfælde er c.o. c. = 0,så I = 1 og interferens afsluttet. Det meste af tiden er de interferensværdier, der erstødt i kortlægning af kromosom loci er mellem 0 og 1; men i visse særlige situationer overstiger observerede fordoblinger forventet,hvilket giver negative interferensværdier.
Rekombinationsanalyse er så stærkt afhængig af trepunkts testkryds og udvidede versioner af dem, at det er værd at lave en trinvis oversigt over analysen, der slutter med en interferensberegning. Vi skal bruge numeriske værdier fra dataene på V, ct og cv loci.
Beregn rekombinante frekvenser for hvert par gener:
repræsenterer koblingsrelationer i et koblingskort:
bestem de dobbelte rekombinante klasser.
Beregn hyppigheden og antallet af forventede dobbeltrekombinanter, hvis der ikke er nogeninterferens:
Beregn interferens:
du har måske undret dig over, hvorfor vi altid bruger heterosygøse hunner til testkrydsninger i vores eksempler på kobling i Drosophila. Nårpr vg / pr+ VG+hanner krydses medpr vg/pr vg hunner, kunpr vg/pr+ vg+og pr vg/pr vg afkom genvindes. Dette resultat viser, at der ikke er nogen krydsning i Drosophilamales. Dette fravær af krydsning hos et køn er imidlertid begrænset til visse arter; det er ikke tilfældet for mænd af alle arter (eller for det heterogametiske køn). I andre organismer er der krydsning hos hankøn og hunkøn. Årsagen til fraværet afkrydsning hos Drosophila hanner er,at de har en usædvanlig profase i uden synaptonemale komplekser.
i øvrigt er der også en rekombinationsforskel mellem menneskelige køn. Kvinder viserhøjere rekombinante frekvenser for de samme loci end mænd.