Čakry, což znamená „kolo“, jsou psychická centra, která leží podél osy páteře jako potenciály vědomí. Obvykle jsou zastoupeny jako lotosy. Čakry nejsou hmotně skutečné a je třeba je chápat jako situované, nikoli v hrubém těle, ale v jemném nebo éterickém těle. Úložiště psychických energií řídí celý stav bytí. Nejčastěji je známý novější systém chodit s někým kolem osmého století CE s hlavním 7 čakry. Ale starověké duchovní indické texty odkazují na různé jiné systémy s variacemi v počtu čaker a jejich umístění.
když je Kundaliní zasažena, probudí se, uvolní se a začne stoupat vzhůru jako ohnivý had, lámající se na každé čakře, když stoupá, dokud se Šakti nespojí se Šivou v sahasrara čakře.
když kundalini dosáhne každé čakry, lotos se otevře a zvedne svůj květ; a jakmile odejde do vyšší čakry, lotos zavře své okvětní lístky a visí dolů, symbolizující aktivaci energií čakry a jejich asimilaci kundalini. Dynamizace Kundaliní, když přechází z jedné čakry do druhé, je rozvinutím duchovního vědomí postupně a říká se, že umožňuje získání jógových sil zvaných siddhis.
zvyšující se počet okvětních lístků lotosu ve vzestupném pořadí může naznačovat rostoucí energii nebo vibrační frekvence příslušných čaker, z nichž každá funguje jako transformátor energií z jedné energie na druhou. Každý z 50 okvětních lístků prvních 6 čaker je spojen s jedním z písmen sanskrtské abecedy.
každá z čaker podle tantry odpovídá jednomu z prvků, z nichž je známý svět složen. Muladhara představuje pevnost; Svadhisthana, likvidita; Manipura, plynný; Anahata, anténa; Vishuddha, éterický, nebo prostor. Celý proces lze vidět jako progresivní transformaci prvků se zvýšením volatility. Každý z prvků prvních pěti čaker je spojen se zvukem: Lam, Vam, Ram, Yam, šunka.
tento výstup přes čakry lze považovat za vzestupnou cestu skrze já, která zjemňuje a subtilizuje energii, která je Kundaliní, až do šesté čakry, Ajny, centra velení, došlo ke kvalitativní změně. Čakry jsou centry transformace psychické nebo duševní energie na duchovní energii.