odeslat…
a. „vyjmout a vložit“: (i) jedna sekvence ve formátu FASTA nebo pouze prosta sekvence, nebo (ii) více sekvencí ve formátu FASTA.
B. soubor ve formátu FASTA. Zadejte cestu k souboru přímo nebo použijtetlačítko „Procházet“ pro nalezení souboru.
poznámka: ChloroP přijímá pouze aminokyselinové sekvence.
zahrnout n-konec
důrazně se doporučuje zahrnout n-konec předložené sekvence.Čím dále od N-koncového zbytku začíná předložená sekvence, tím víceobtížná a nespolehlivá bude predikce.
přednostně předloží kolem 100 zbytků
pokud možno předloží asi 100 N-koncových zbytků. Navrhovaná délka je dána skutečností, že prediktor „cTP“/“no cTP“ byl vyškolen se vstupními sekvencemi zbytků délky 100. Kratší sekvence však mohou být také uspokojivépředpovězeno (je důležitější, aby N-koncová část byla neporušená). Predikce místa čištění je omezena na hledání potenciálního místa štěpení ve 100 většině n-terminálních zbytků a není sama o sobě ovlivněna délkou následků.
Názvy sekvencí
název sekvencí může mít libovolnou délku, ale pouze prvních 20 znaků bude zachováno v celé predikci a prezentováno na stránce s výsledky predikce chloropu.
podrobný výstup
zaškrtněte toto políčko, pokud chcete, aby skóre neuronové sítě bylo prezentováno také pro každou sekvenci (a nejen pro každou sekvenci).Derivace síťového skóre použitá pro nalezení oblasti, ve které je hledáno místo čištění (40 reziduí obklopujících reziduum s nejvyšším derivátovým skóre), je také uvedena spolu se štěpným místem (CS-skóre) pro každý zbytek.