Clostridia jsou grampozitivní, anaerobní, endospore tvořící bakterie, neschopné disimilační redukce síranu. Zahrnuje přibližně 180 druhů, Rod Clostridium je jedním z největších bakteriálních rodů. Fyziologie je většinou věnována produkci kyseliny. Je známo mnoho cest, jako je fermentace homoacetátu acetogeny, fermentace propionátu Clostridium propionicum a fermentace butyrátu / butanolu C. acetobutylicum, známý výrobce rozpouštědel. Klostridie degradují cukry, alkoholy, aminokyseliny, puriny, pyrimidiny a polymery, jako je škrob a celulóza. Úspora energie může být prováděna fosforylací na úrovni substrátu i vytvářením iontových gradientů. Tvorba endospor se podobá mechanismu objasněnému v bacilu. Morfologie, obsah a vlastnosti spór jsou velmi podobné endosporám bacilů. Sporulační klostridie obvykle tvoří oteklé mateřské buňky a hromadí skladovací látku granulózu. Klostridiální sporulace se však liší tím, že nepoužívá tzv. Iniciace začíná přímou fosforylací hlavního regulátoru Spo0A. kaskáda sporulačně specifických sigma faktorů je opět totožná s tím, co je známo z bacilu. Nástup sporulace je u některých druhů spojen buď s tvorbou rozpouštědla (aceton, butanol)nebo toxinu (např. C. perfringens enterotoxin). Klíčení spór je často indukováno různými aminokyselinami, často v kombinaci s fosfátovými a sodnými ionty. V lékařských aplikacích se spory C. butyricum používají jako C. difficile profylaxe a jako léčba proti průjmu. Rekombinantní spory jsou v současné době zkoumány a testovány jako protinádorová činidla, protože klíčí pouze v hypoxických tkáních (tj.