Dna polymerázové upínací nakladače

chromozomální replikace DNA vyžaduje, aby DNA polymerázy byly uvázány na kruhové kluzné svorky, které obklopují DNA a umožňují vysokorychlostní procesní replikaci. Posuvné svorky jsou naloženy na DNA komplexem svorkového nakladače, pentamerickou sestavou proteinů rodiny ATPÁZ AAA+.

chceme pochopit funkci a mechanismus svorkových nakladačů v atomových detailech. Nedávné struktury nakladače bakteriofágů T4 v komplexu s DNA primer-template a posuvnou svorkou navrhly pracovní model pro mechanismus zavaděče svorek, jak je uvedeno níže (viz Kelch et al Science 2011):

náš model předpovídá, že hydrolýza ATP začíná na konci spirály AAA+ a postupuje postupně po spirále, což vede k vysunutí svorkového nakladače z DNA a uzavřené svorky. Naše hypotéza je ilustrována v této animaci tří po sobě jdoucích událostí hydrolýzy ATP:

tyto modely budeme testovat pro mechanismus zavaděče svorek pomocí široké škály biochemických, biofyzikální a strukturální metody. Pochopení mechanismu zavaděče svorek v atomových detailech bude mít důležité důsledky pro pochopení replikace DNA a mechanismu souvisejících proteinových sestav AAA+. Nakonec předpokládáme, že pomocí našeho mechanistického porozumění vyvineme nové nanodevice a efektory malých molekul funkce AAA+.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.